DiODeProject/MuMoT

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Multiscale Modelling Tool - mathematical modelling without the maths

Stelle: 24
Fork: 5
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 59

Lingua principale: Python
Licenza: GPL-3.0
Ultimo push su GitHub: 18/3/2022
Ultima indicizzazione: 15/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: help wanted good first issue
Metriche di merge delle PR: Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Add CFF file to make it easier for others to cite MuMoT Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#412 · 1 commento · Aperta il 28/7/2021
Changing visualisation type of MuMoTstochasticSimulationViews through GUI causes plot deformations (squeezing) Aperta

bug

DiODeProject/MuMoT#409 · 1 assegnatario · Aperta il 29/6/2020
Intermittently hitting cell execution timeout of 120 seconds Aperta

bug testing

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

DiODeProject/MuMoT#407 · 2 commenti · Aperta il 2/6/2020
Use of bare 'except:' is bad Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiODeProject/MuMoT#387 · 1 commento · Aperta il 14/2/2020
Multicontroller do not accept some of the plotting parameters that normal controllers support Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiODeProject/MuMoT#385 · Aperta il 14/2/2020
Do not suppress tracebacks when running 'test' notebooks via nbval Aperta

enhancement testing

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#384 · 3 commenti · Aperta il 10/2/2020
Configure logging via 'logging' module Aperta

enhancement testing

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#383 · Aperta il 10/2/2020
model2.showODEs(method='vanKampen') -> IndexError: list index out of range Aperta

bug testing

DiODeProject/MuMoT#377 · 7 commenti · 2 assegnatari · Aperta il 3/2/2020
Switch to using matplotlib's object-oriented API Aperta

enhancement question

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#367 · 1 commento · Aperta il 1/10/2019
Reduce runtime of CI jobs? Aperta

enhancement question

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

DiODeProject/MuMoT#366 · Aperta il 1/10/2019
Muticontroller plot warning Aperta

warning

DiODeProject/MuMoT#355 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 28/9/2019
Multicontrollers missing some advanced options Aperta

bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiODeProject/MuMoT#353 · Aperta il 27/9/2019
Clean exceptions Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#352 · 3 commenti · Aperta il 27/9/2019
Add unit tests Aperta

testing

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#339 · Aperta il 20/8/2019
Visualise noise in 3d stream plot Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#336 · 2 assegnatari · Aperta il 9/8/2019
Document 1d and 3d stream plots Aperta

documentation

DiODeProject/MuMoT#335 · 1 assegnatario · Aperta il 9/8/2019
Replace global var figcounter with matplotlib.pyplot.get_fignums()? Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#333 · 1 commento · Aperta il 9/8/2019
1d stream plot does not appear in full after re-generation using sliders Aperta

bug help wanted

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiODeProject/MuMoT#329 · Aperta il 23/7/2019
Add type hints Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

DiODeProject/MuMoT#328 · Aperta il 23/7/2019
Update contributors Aperta

documentation

DiODeProject/MuMoT#327 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 22/7/2019
Enhance random walk computation Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#326 · 1 assegnatario · Aperta il 22/7/2019
Test suite: run all notebooks in one or more dirs rather than explicitly named notebooks Aperta

enhancement testing

DiODeProject/MuMoT#325 · 9 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 17/7/2019
Greek letters should be used consistently in all functions Aperta

DiODeProject/MuMoT#324 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 2/7/2019
Consider pointing binder icon to latest release branch Aperta

documentation enhancement question

DiODeProject/MuMoT#320 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 4/4/2019
Consider DOI release assignment strategy Aperta

documentation question

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

DiODeProject/MuMoT#319 · 1 commento · Aperta il 4/4/2019
Implement custom download results widget Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#308 · Aperta il 22/3/2019
Enable result download for non-stochastic simulation views Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#305 · Aperta il 21/3/2019
Check advanced multicontroller bookmarks Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 62/100

DiODeProject/MuMoT#292 · Aperta il 4/3/2019
aggregateResults toggle in MuMoTfieldController should only trigger replotting without re-computing all data Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

DiODeProject/MuMoT#284 · Aperta il 28/2/2019
MuMoTfieldController should include the toggle 'plotProportions' as most other controllers do Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#283 · Aperta il 28/2/2019
showNoise in MuMoTfieldControllers should be treated as all other parameters and a widget created accordingly Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#282 · Aperta il 28/2/2019
remove MuMoTcontroller._plotLimitsWidget and use the self._widgetsExtraParams['plotLimits'] Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

DiODeProject/MuMoT#281 · 4 commenti · Aperta il 28/2/2019
Implement more sophisticated analytic and numerical noise solutions / approximations Aperta

enhancement help wanted

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

DiODeProject/MuMoT#251 · Aperta il 11/1/2019
Implement model cell bookmarking Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#244 · Aperta il 19/12/2018
Bifurcation() fails to find all branches Aperta

help wanted question

DiODeProject/MuMoT#228 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 26/11/2018
SSA multiple runs plots: change box plots for shaded confidence intervals Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#227 · 1 assegnatario · Aperta il 26/11/2018
Expand options for types of graphs in multiagent() network topology Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#226 · 1 assegnatario · Aperta il 26/11/2018
Feature request: support for 2-simplex (ternary) plot Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#225 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 26/11/2018
Feature request: create and save animated gif of multiagent or SSA runtime plots Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#224 · 1 assegnatario · Aperta il 26/11/2018
Allow substitute() to perform simple reactants scaling and time scaling Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#222 · 1 assegnatario · Aperta il 26/11/2018
Stream lines shading should be scaled to avoid barely visible stream lines Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#218 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 26/11/2018
Add figures based on parameter sweeps of numerical simulations Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

DiODeProject/MuMoT#212 · Aperta il 25/10/2018
Use parser library in parseModel Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#199 · 1 commento · Aperta il 10/10/2018
Readthedocs should open external sites in new browser windows Aperta

documentation enhancement

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 42/100

DiODeProject/MuMoT#198 · 2 commenti · Aperta il 10/10/2018
Use nbval to perform regression testing on MuMoTtest.ipynb Aperta

enhancement testing

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiODeProject/MuMoT#187 · Aperta il 10/10/2018
Add plot of noise spectrum from noise solutions Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#165 · 1 assegnatario · Aperta il 2/8/2018
LaTeX in output cells slow to render Aperta

bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#162 · Aperta il 1/8/2018
Allow for creating models from Python strings Aperta

enhancement good first issue

DiODeProject/MuMoT#156 · 6 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 25/7/2018
Allow multicontrollers to encapsulate multiple models Aperta

enhancement

DiODeProject/MuMoT#141 · 1 assegnatario · Aperta il 9/6/2018
The dropdown widget of MuMoTstochasticSimulationController for the Final distribution visualisation does not render latex correctly Aperta

wontfix

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiODeProject/MuMoT#136 · 1 commento · Aperta il 26/5/2018

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