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obophenotype

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The Unified Phenotype Ontology (uPheno) integrates multiple phenotype ontologies into a unified cross-species phenotype ontology.

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HP:0003234 Decreased circulating carnitine concentration: add synonym "Low carnitine"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11799 · 2026年10月9日建立
HP:0003235 Hypermethioninemia: add synonym "Elevated methionine"
未關閉
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難度 2/5 1-3 小時新手友好度 74/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11798 · 2026年10月9日建立
HP:0000848 Increased circulating renin concentration: add synonym "Elevated renin"
未關閉
- 哪裡不對？
難度 2/5 1 小時以內新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11797 · 2026年10月9日建立
HP:0003154 Increased circulating ACTH level: add synonym "Elevated ACTH"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 65/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11796 · 2026年10月9日建立
HP:0002925 Elevated circulating thyroid-stimulating hormone concentration: add synonym "Elevated TSH"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 62/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11795 · 2026年10月9日建立
HP:0003165 Elevated circulating parathyroid hormone level: add synonym "Elevated PTH"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 68/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11794 · 2026年10月9日建立
HP:0001987 Hyperammonemia: add synonym "Elevated ammonia"
未關閉
- 哪裡不對？
難度 1/5 1 小時以內新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11793 · 2026年10月9日建立
HP:0002151 Increased circulating lactate concentration: add synonym "Elevated lactate"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11792 · 2026年10月9日建立
HP:0003236 Elevated circulating creatine kinase activity: add synonym "Elevated CK"
未關閉
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難度 2/5 1 小時以內新手友好度 75/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11791 · 2026年10月9日建立
HP:0004372 Reduced consciousness: add synonym "Impaired consciousness"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 70/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11790 · 2026年10月9日建立
HP:0000678 Dental crowding: add synonym "Crowded dentition"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 82/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11789 · 2026年10月9日建立
HP:0002890 Thyroid carcinoma: add synonym "Thyroid cancer"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 65/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11788 · 2026年10月9日建立
HP:0001789 Hydrops fetalis: add synonym "Fetal hydrops", "Foetal hydrops"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11787 · 2026年10月9日建立
HP:0031217 Hot flashes: add synonym "Hot flushes"
未關閉
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難度 2/5 1-3 小時新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11786 · 2026年10月9日建立
HP:0012343 Decreased circulating ferritin concentration: add synonym "Hypoferritinemia", "Hypoferritinaemia"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 82/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11785 · 2026年10月9日建立
HP:0100023 Recurrent hand flapping: add synonym "Hand flapping"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11784 · 2026年10月9日建立
HP:0002788 Recurrent upper respiratory tract infections: add synonym "Recurrent URTI"
未關閉
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難度 1/5 1 小時以內新手友好度 68/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11783 · 2026年10月9日建立
HP:0006548 Pulmonary arteriovenous malformation: add synonym "Pulmonary AVM"
未關閉
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難度 2/5 1 小時以內新手友好度 70/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11782 · 2026年10月9日建立
HP:0002671 Basal cell carcinoma: add synonym "BCC"
未關閉
- 哪裡不對？
難度 1/5 1 小時以內新手友好度 75/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11781 · 2026年10月9日建立
HP:0001520 Large for gestational age: add synonym "LGA"
未關閉
- 哪裡不對？
難度 1/5 1 小時以內新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11780 · 2026年10月9日建立
HP:0000097 Focal segmental glomerulosclerosis: add synonym "FSGS"
未關閉
- 哪裡不對？
難度 1/5 1 小時以內新手友好度 78/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11779 · 2026年10月9日建立
HP:0004430 Severe combined immunodeficiency: add synonym "SCID"
未關閉
- 哪裡不對？
難度 2/5 1-3 小時新手友好度 72/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11778 · 2026年10月9日建立
HP:0001657 Prolonged QT interval: add synonym "LQTS"
未關閉
- 哪裡不對？
難度 1/5 1 小時以內新手友好度 75/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11777 · 2026年10月9日建立
NTR: extended amygdala (DHBA:10383)
未關閉
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new term request

難度 3/5 1-2 天新手友好度 68/100

obophenotype/uberon#3783 · 2026年10月6日建立
Replace the placeholder scope comment on UPHENO:0001001 with wording agreed at an editors' call
未關閉
- 哪裡不對？
難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

obophenotype/upheno#1038 · 2026年10月1日建立
Retire or repurpose the `phenotype_modified` DOSDP pattern
未關閉
- 哪裡不對？
難度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

obophenotype/upheno#1037 · 2026年10月1日建立
Run LLM mapping validation over the uPheno cross-species mappings
未關閉
- 哪裡不對？
難度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

obophenotype/upheno#1036 · 2026年10月1日建立
Ontology QC workflow has been failing continuously: merged_import.owl does not exist in CI
未關閉
- 哪裡不對？
難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

obophenotype/upheno#1035 · 2026年10月1日建立
make with COMP=false fails: HRA component overrides in uberon.Makefile depend on undefined stamp rule (breaks #gogoeditdiff)
未關閉
- 哪裡不對？
難度 2/5 1-3 小時新手友好度 84/100

obophenotype/uberon#3780 · 2026年9月28日建立
[NTR] colonocyte progenitor cell
可能重新可做關聯的 PR 已關閉且未合併。未關閉
- 哪裡不對？
new term request

難度 3/5 1-2 天新手友好度 68/100

obophenotype/cell-ontology#3753 · 9 則留言 · 1 個 reaction · 已指派 1 人 · 2026年9月28日建立

維護者通常 1 天內回覆
Release workflow does not generate `chebi_slim.owl`
未關閉
- 哪裡不對？
難度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

obophenotype/chebi_obo_slim#57 · 4 則留言 · 2026年9月25日建立
Recover the translator for 87 unattributed Arabic rows
未關閉
- 哪裡不對？
難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

obophenotype/hpo-translations#52 · 2026年9月25日建立
Refresh 112 stale OBA labels in the EFO and LOINC mapping sheets after the level → amount relabel
未關閉
- 哪裡不對？
難度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

obophenotype/bio-attribute-ontology#453 · 2026年9月24日建立
Add image and reference metadata link to 'respiratory tract multiciliated cell'
未關閉
- 哪裡不對？
難度 1/5 1 小時以內新手友好度 85/100

obophenotype/cell-ontology#3750 · 2026年9月23日建立

維護者通常 1 天內回覆
Review how HPO models enzyme concentration vs activity
未關閉
- 哪裡不對？
難度 5/5 一週以上新手友好度 30/100

obophenotype/human-phenotype-ontology#11772 · 1 則留言 · 2026年9月21日建立
[Fix] UBERON:0003351 'pharyngeal epithelium' is chordate-restricted but generically labelled
未關閉
- 哪裡不對？
難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

obophenotype/uberon#3776 · 1 則留言 · 2026年9月18日建立
[NTR] cloaca outside Vertebrata, or generalise UBERON:0000162
未關閉
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new term request

難度 5/5 一週以上新手友好度 42/100

obophenotype/uberon#3775 · 1 則留言 · 2026年9月18日建立
[NTR] respiratory tree (Holothuroidea)
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new term request

難度 3/5 1-2 天新手友好度 70/100

obophenotype/uberon#3774 · 1 則留言 · 2026年9月18日建立
11 definitions in the 2026-06-19 release promise a `part_of` the axioms do not state, and 21 HPO phenotype definitions rest on those terms, and 20 automatic definitions place a metapodial element inside a digit the axioms declare disjoint from it
未關閉
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難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

obophenotype/uberon#3773 · 2026年9月18日建立
Update readme to have relevant content
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難度 2/5 1-3 小時新手友好度 35/100

obophenotype/zebrafish-phenotype-ontology#78 · 2026年9月16日建立
Missing has_part relations to CL: systematic scan of term definitions (33 evidence-backed candidates)
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- 哪裡不對？
難度 5/5 一週以上新手友好度 25/100

obophenotype/uberon#3769 · 2026年9月14日建立
"thigh" may not be an appropriate exact synonym of `hindlimb stylopod`
未關閉
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難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

obophenotype/uberon#3768 · 5 則留言 · 2026年9月11日建立
Definitions vs axioms in the 2026-06-19 release: a tooth both inside the head and disjoint from it, three terms whose definition and axiom disagree, and 12 candidate `part_of` axioms
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難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

obophenotype/uberon#3767 · 1 則留言 · 2026年9月11日建立
[Bug] chromaffin cell (CL:0000166) is inferred to be a neuron via the neuroendocrine cell equivalence, and inherits a hidden develops_from restriction
未關閉
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bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

obophenotype/cell-ontology#3741 · 2026年9月10日建立

維護者通常 1 天內回覆
[Bug] Hidden GCI: epithelial cell of thyroid gland (CL:0002257) gives parafollicular cell an endodermal origin, contradicting its neural crest derivation
未關閉
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bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 68/100

obophenotype/cell-ontology#3740 · 2026年9月10日建立

維護者通常 1 天內回覆
[Bug] Hidden GCI: lamp5 GABAergic interneuron (CL:4023011) puts a caudal ganglionic eminence origin on the MGE-derived Lamp5 Lhx6 neuron
可能重新可做 @dosumis 於 29 天前認領，目前沒有進行中的 PR。未關閉
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bug

obophenotype/cell-ontology#3739 · 已指派 1 人 · 2026年9月10日建立

維護者通常 1 天內回覆
Term Request: Marginal keratitis
可能重新可做 @pnrobinson 於 29 天前認領，目前沒有進行中的 PR。未關閉
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new term request

obophenotype/human-phenotype-ontology#11756 · 已指派 1 人 · 2026年9月10日建立
Peripheral retinal degeneration is not Progressive loss of peripheral retinal pigment epithelium...
可能重新可做 @pnrobinson 於 30 天前認領，目前沒有進行中的 PR。未關閉
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textual definition

obophenotype/human-phenotype-ontology#11755 · 已指派 1 人 · 2026年9月9日建立
Term Request: Beaten metal appearance of corneal endothelium
可能重新可做 @pnrobinson 於 31 天前認領，目前沒有進行中的 PR。未關閉
- 哪裡不對？
new term request

obophenotype/human-phenotype-ontology#11754 · 已指派 1 人 · 2026年9月8日建立
Term Request: Moon crater-like corneal endothelial lesions
可能重新可做 @pnrobinson 於 31 天前認領，目前沒有進行中的 PR。未關閉
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obophenotype/human-phenotype-ontology#11753 · 已指派 1 人 · 2026年9月8日建立

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