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Update Xenium dataset

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Documentazione
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
jupyter-notebook
Ambito
data, documentation

Direzione di ricerca

Individua il notebook Xenium e verifica come viene attualmente referenziato il dataset XOA 2.0. Confronta i dataset 10x collegati e determina se usarne uno o attendere dati stabili del pannello 5K; l’attività è completata quando il notebook usa il dataset selezionato e continua a essere eseguito correttamente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

The Xenium notebook is using a previous dataset (for XOA 2.0). We should consider using on the following recent datasets, recommended by the 10x team:

In alternative we could use the preview data for the 5K panel:

Or even better,

  • wait until a stable version of the 5K panel data is released and use that.
Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
67
Fork
26
Merge medio
4m
PR unite (30g)
1

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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