Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

[Feature]: Add generalized gamma index likelihood

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#497 16 bình luận 0 reaction 3 người được giao Xem trên GitHub

@Cole-Monnahan-NOAA đang làm issue này rồi.

Từ ngày 10/10/2023.

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Mô tả

statistics survey_&_Q wishlist
Describe the solution you would like.

In many cases I believe it is more statistically justifiable to use a more flexible index likelihood than the lognormal. One appealing alternative is the generalized gamma distribution (GGD). It requires reading in a third parameter ("Q"), and has a complicated PDF function.

I forked the repo and have added a prototype on this branch and it appears to work well on the few models I've tested. It also does not appear to break backwards compatibility because the new data are only read in with the new likelihood option.

The point of this issue is to gauge the interest in this feature by the SS3 team for incorporating this into a future release of SS3. IF so, how should I proceed with development (git workflow, timing, testing, etc.)?

I think the only other main component to add is a simulator for the bootstrapper, and perhaps some reporting? I'll need help with the latter. I also need to further comment the code and update the documentation.

Describe alternatives you have considered

None so far

Statistical validity, if applicable

In many (most?) cases there is no statistical justification for assuming a lognormal index resulting from a design-based or model-based estimator. This is because sums of positive r.v.s are not necessarily lognormal, even if each r.v. is lognormal. Thus a more flexible distribution which can more accurately convey the information in the survey biomass indices is needed.

Describe if this is needed for a management application

No response

Additional context

No response

Ngôn ngữ chính
C++
Star
46
Fork
20
Merge trung bình
2 ngày 6 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
1

Chuẩn bị môi trường

Mở trong Codespaces

Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của nmfs-ost/ss3-source-code

Tất cả issue của nmfs-ost/ss3-source-code

Issue tương tự

Thêm issue về C++

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.