Check all possible g:Profiler target dbs for numerical IDs
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 3/5
- Thời gian dự kiến
- 1-2 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 58/100
Hướng nghiên cứu
Start by finding the ID mapping step that calls g:Profiler and trace how it chooses the target database for numerical IDs. Update the mapping behavior to check all target databases, then verify that 8173941 for Homo sapiens returns a result when the default ENTREYGENE_ACC does not. The issue names no relevant files or tests, so locating the implementation and a suitable verification path will take some reading.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Description of the bug
When mapping IDs like 8173941 for homo sapiens, only a specific target db works. The default ENTREYGENE_ACC does not return any result.
The ID mapping step should check all target dbs for numerical IDs.
Command used and terminal output
Relevant files
No response
System information
No response
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 10
- Fork
- 4
- Merge trung bình
- 1 ngày 22 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 9
Chuẩn bị môi trường
Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.
- Không có Dockerfile hay tệp Docker Compose
- Có mẫu pull request
- Đọc hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của nf-core/stableexpression
-
bug
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
nf-core/stableexpression#64 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
bug
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100
nf-core/stableexpression#59 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Check species name at the very beginning of the pipeline using the NCBI Datasets APICó thể làm lại được @OlivierCoen đã nhận 43 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mởenhancement
nf-core/stableexpression#35 · 1 người được giao ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
Tất cả issue của nf-core/stableexpression
Issue tương tự
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 4 ngày
-
Add alembic upgrade predeployĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 62/100
ClockGU/clockwork-backend#169 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 76/100
aws-samples/sample-per-model-bedrock#616 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 74/100
chnm/teachinghistory-hugo#47 ·
-
good first issue
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 67/100
pandas-dev/pandas-stubs#2047 · 2 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày