Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

java.lang.RuntimeException: Missing event detected.

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#59 17 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
5/5
Thời gian dự kiến
Hơn một tuần
Mức phù hợp với người mới
15/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
java
Lĩnh vực
cli

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách tái hiện lệnh mixcr analyze đã được báo cáo với các đầu vào FASTQ bị ảnh hưởng và tập trung vào bước assemble, nơi xảy ra lỗi Missing event. Issue không nêu tệp hoặc test nào trong repository; công việc được xem là hoàn tất khi xác định được nguyên nhân đối với các đầu vào này và ghi chép hoặc sửa lỗi.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Hello,

I run mixcr on all my bulk mi laboratories tcr data but I encounter a problem for two of them. Do you know what happen? Does somebody already encounter this message?

Many thanks

My code:

/Users/alegac/opt/anaconda3/pkgs/mixcr-4.4.1-0/bin/mixcr -Xmx15g analyze milab-human-rna-tcr-umi-multiplex /Users/alegac/Documents/bulk_tcr/S1/s1_trimmed_R1.fastq.gz /Users/alegac/Documents/bulk_tcr/S1/s1_trimmed_R2.fastq.gz /Users/alegac/Documents/bulk_tcr/S1/results_01

My error :

Writing pre-clones: 72% ETA: 00:01:20
Writing pre-clones: 82,4% ETA: 00:00:44
Writing pre-clones: 92,7% ETA: 00:00:17
Writing pre-clones: 40,6%
Initialization: progress unknown
4.4.1; built=Thu Jul 06 19:36:41 CEST 2023; rev=f7cd556c6c; lib=repseqio.v3.0.1
picocli.CommandLine$ExecutionException: Error while running command assemble java.lang.RuntimeException: Missing event detected.
at com.milaboratory.mixcr.cli.Main.registerExceptionHandlers$lambda-12(SourceFile:323)
at picocli.CommandLine.execute(CommandLine.java:2088)
at com.milaboratory.mixcr.cli.CommandAnalyze$Cmd$PlanBuilder.executeSteps(SourceFile:470)
at com.milaboratory.mixcr.cli.CommandAnalyze$Cmd.run0(SourceFile:412)
at com.milaboratory.mixcr.cli.MiXCRCommand.run(SourceFile:37)
at picocli.CommandLine.executeUserObject(CommandLine.java:1939)
at picocli.CommandLine.access$1300(CommandLine.java:145)
at picocli.CommandLine$RunLast.executeUserObjectOfLastSubcommandWithSameParent(CommandLine.java:2358)
at picocli.CommandLine$RunLast.handle(CommandLine.java:2352)
at picocli.CommandLine$RunLast.handle(CommandLine.java:2314)
at picocli.CommandLine$AbstractParseResultHandler.execute(CommandLine.java:2179)
at picocli.CommandLine$RunLast.execute(CommandLine.java:2316)
at com.milaboratory.mixcr.cli.Main.registerLogger$lambda-26(SourceFile:426)
at picocli.CommandLine.execute(CommandLine.java:2078)
at com.milaboratory.mixcr.cli.Main.main(SourceFile:98)
Caused by: java.lang.RuntimeException: Missing event detected.
at com.milaboratory.o.hN.a(SourceFile:59)
at com.milaboratory.o.hT$c.accept(SourceFile:1484)
at cc.redberry.pipe.blocks.FilteringPort.take(FilteringPort.java:65)
at cc.redberry.pipe.blocks.O2ITransmitter.run(O2ITransmitter.java:63)
at java.base/java.lang.Thread.run(Thread.java:829)

Ngôn ngữ chính
SCSS
Star
5
Fork
6
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của milaboratory/docs

Tất cả issue của milaboratory/docs

Issue tương tự

Thêm issue về CLI

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.