A python interface for the CIViC db application

griffithlab/civicpy は初心者に優しい?

griffithlab/civicpy への外部コントリビューターの PR が最近は少なく、どのくらいマージされるかはまだ言えません。 初心者向けのオープンな issue は今はありません。下の一覧に、このリポジトリのほかの issue があります。

スター
13
フォーク
8
オープンの初心者向け issue
0
索引済み issue
32
主要言語
Python
ライセンス
MIT
最終 GitHub push
2026年7月17日
最新の索引
2026年9月20日
コントリビューションガイド
コントリビューションガイドがありません
行動規範
行動規範がありません
初心者向けラベル
初心者向けラベルは索引されていません
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

griffithlab/civicpy にコントリビュートするには

  1. コントリビューションガイドはないので、README と最近マージされた PR をいくつか読んで、変更の出し方をつかみましょう。
  2. Dockerfile または Docker Compose ファイルがあるので、ツールチェーン一式を入れなくても動かせます。
  3. あなたのコントリビュートはプロジェクトの MIT ライセンスで公開されます。
  4. リポジトリをフォローすれば、新しい初心者向け issue が出たときにわかります。下のほかの issue も見てみましょう。
issue を読み込んでいます

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • GKS: Store the ClinVar Entry star
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

    griffithlab/civicpy#257 ·

  • GKS: Add support for representing evidence star ratings
    再び着手できるかも @korikuzma が 63 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    griffithlab/civicpy#256 · 担当者 1 名 ·

  • GKS: Add support for MPs with cDNA changes in the name
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

    griffithlab/civicpy#255 · コメント 2 件 ·

  • Create GKS Bundle Format for GKS JSON file
    再び着手できるかも @korikuzma が 92 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    griffithlab/civicpy#249 · 担当者 1 名 ·

  • Represent FDA Regulatory Approval, FDA Companion Test, and NCCN Guideline using GKS
    再び着手できるかも @korikuzma が 113 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    griffithlab/civicpy#244 · 担当者 1 名 ·

  • update `TestCivicGksPredictiveAssertion` once we have an actual approved predictive assertion that is submitted to clinvar
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    griffithlab/civicpy#234 ·

  • Add a reference genome option to `create-vcf` in order to support GRCh38
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 68/100

    griffithlab/civicpy#222 ·

  • Incorrect INFO field encoding in annotate-vcf output, and GRCh38 support for create-vcf
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    griffithlab/civicpy#221 · コメント 2 件 ·

  • GKS Exporter: Add assembly information to variant
    再び着手できるかも @korikuzma が 222 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    griffithlab/civicpy#210 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 ·

  • GKS Exporter: Use Cat-VRS and VRS
    再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#209 · コメント 4 件 ·

  • Handle GeneVariants with GRCh38 coordinates in the VCF creation step
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 32/100

    griffithlab/civicpy#195 ·

  • Endorse different assertion in staging
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    griffithlab/civicpy#194 ·

  • CIViC GKS Export should not support complex molecular profiles
    再び着手できるかも @korikuzma が 455 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    griffithlab/civicpy#191 · 担当者 1 名 ·

  • CIViC GKS Exporter should support complex molecular profiles
    再び着手できるかも @korikuzma が 456 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

    griffithlab/civicpy#185 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 ·

  • GRCh38 query - offline environment
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#182 · コメント 2 件 · リアクション 2 件 ·

  • Add heartbeat API tests
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    griffithlab/civicpy#163 ·

  • Add GKS transformer support for FusionVariants
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    griffithlab/civicpy#162 ·

  • Pull back is_flagged boolean for entities that can be flagged
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#159 ·

  • therapy names aren't unique per Evidence, and Disease property field sometimes is not there
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    griffithlab/civicpy#153 · コメント 2 件 ·

  • Handle stale remote caches
    オープン

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    griffithlab/civicpy#142 ·

  • is there any useful examples of how to use it
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#119 ·

  • activity caching and search
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#101 ·

  • speed up tests
    オープン
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#93 · コメント 1 件 ·

  • No remote queries option
    オープン
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    griffithlab/civicpy#74 · コメント 1 件 ·

  • add support for revisions and projections
    オープン
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#50 · コメント 1 件 ·

  • refactor object retrieval from cache
    再び着手できるかも @ahwagner が 2596 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン
    bug

    griffithlab/civicpy#48 · 担当者 1 名 ·

  • validate coordinates
    オープン

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    griffithlab/civicpy#15 ·

  • add CIViCpy to ProgrammableWeb directory
    オープン

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 30/100

    griffithlab/civicpy#8 ·

  • Support GRCH37 to 38 conversion
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#4 · コメント 2 件 ·

  • add contributions by user summarizations
    オープン

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    griffithlab/civicpy#1 ·

  • GKS: Extension names should use camel case naming convention
    対応中かも @korikuzma が 126 日前に担当しました。 オープン

    griffithlab/civicpy#243 · 担当者 1 名 ·

  • GKS Exporter: Support Oncogenicity Assertions
    対応中かも @korikuzma が 201 日前に担当しました。 オープン
    enhancement

    griffithlab/civicpy#217 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 ·

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