Hacktoberfest 2026：メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

cytomining/CytoTable

ログインしてフォロー GitHub で見る

Harmonize high-content image analysis tool outputs for processing with Pycytominer and other Cytomining tools.

cytomining/CytoTable は初心者に優しい？

cytomining/CytoTable への外部コントリビューターの PR が最近は少なく、どのくらいマージされるかはまだ言えません。 初心者向けのオープンな issue は今はありません。下の一覧に、このリポジトリのほかの issue があります。

スター
21
フォーク
6
オープンの初心者向け issue
0
索引済み issue
81
平均マージ
1日 3時間
マージ済み PR（30日）
3
主要言語
Python
ライセンス
BSD-3-Clause
最終 GitHub push
2026年10月6日
最新の索引
2026年9月15日
コントリビューションガイド
行動規範
初心者向けラベル
初心者向けラベルは索引されていません

cytomining/CytoTable にコントリビュートするには

  1. まずコントリビューションガイドを読みましょう。変更の提案、テスト、レビューの進め方が書かれています。
  2. 行動規範も読んでおきましょう。チャットだけでなく issue や PR にも適用されます。
  3. あなたのコントリビュートはプロジェクトの BSD-3-Clause ライセンスで公開されます。
  4. リポジトリをフォローすれば、新しい初心者向け issue が出たときにわかります。下のほかの issue も見てみましょう。
初心者向け すべて
オープン すべて

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • Enable remote SQLite references
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#485 ·

  • NameError: Cytotable not defined
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    cytomining/CytoTable#476 · コメント 3 件 ·

  • Find a way for users to avoid SQL configurations
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

    cytomining/CytoTable#454 · コメント 1 件 ·

  • Question: Best practices to limit CPU usage?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#437 · コメント 5 件 · リアクション 1 件 ·

  • Refactor `convert.py` with greater modularity
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#430 ·

  • Image features and important Metadata fields missing from parquets
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    cytomining/CytoTable#425 · コメント 5 件 ·

  • Check for empty or zero row tables (provide specific warning)
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#409 ·

  • Fail to summarize across plate
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#377 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 ·

  • Can't run examplehuman
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#374 · コメント 7 件 ·

  • Consider use of `pyarrow.lib.RecordBatchReader` for internal streamable data handling
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#371 ·

  • Using compartments to input CSVs with custom names
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#362 · コメント 6 件 ·

  • New CytoTable preset?
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    cytomining/CytoTable#358 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 ·

  • Add anndata input capabilities
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#347 ·

  • Error when a cell-nucleus pair does not exists: IndexError: list index out of range
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    cytomining/CytoTable#339 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 ·

  • Add code coverage details to readme
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    documentation

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#336 ·

  • Cleanup `parsl` logging directory and make unique by default for concurrent usage
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#330 · コメント 3 件 ·

  • Migrate from `mypy` to `ty` for type linting
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#329 ·

  • Add DuckDB as a data source
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

    cytomining/CytoTable#319 ·

  • Add Parquet as a data source
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#318 ·

  • Add command-line interface (CLI)
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    cytomining/CytoTable#316 ·

  • Add PathName as default to extract for CytoTable
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 42/100

    cytomining/CytoTable#305 · リアクション 1 件 ·

  • How do we determine what CellProfiler `features` are `metadata` or not?
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#294 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 ·

  • Add single-cell images to output
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#262 ·

  • Add Lance output option
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

    cytomining/CytoTable#261 ·

  • Installation may hang for long periods during dependency resolutions for `boto3` or `botocore`
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#224 ·

  • Reduce join operation memory consumption
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#223 ·

  • Make root cause exceptions more visible through customized handling and/or logging
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#222 ·

  • Issue Running in Jupyter Notebook for convert_parquet Function
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#221 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 ·

  • Update `CITATION.cff` with contributors
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#219 ·

  • Set temporary cache locations of dependencies from one location
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#218 ·

  • Add timeout for large directory parsing in source processing
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#209 ·

  • Extract or somehow store data from CellProfiler `experiment` tables in CytoTable output
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    cytomining/CytoTable#203 ·

  • Retain extracted, unjoined table output when joining data in CytoTable
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#202 ·

  • Define ideal compartment and metadata table relationships for joins to avoid returning NA results
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#201 ·

  • Provide data statistics report as part of CytoTable output
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#200 · コメント 1 件 ·

  • Enable `_concat_source_group` single file pass-through to avoid rewrites
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 55/100

    cytomining/CytoTable#191 ·

  • Add capability to sample source datasets by percent or rowcount to increase speed of testing
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#190 · コメント 1 件 ·

  • Consistently handle `Metadata_Well` and `Metadata_Plate` column renaming and join specification
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#189 ·

  • Verify how large floating-point numbers are exported
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    cytomining/CytoTable#187 · コメント 3 件 · 担当者 1 名 ·

  • Add SBOM file to repository
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#185 ·

  • Use OpenLineage API (or other similar tooling) as basis for CytoTable Paquet metadata output
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#180 ·

  • Document Parsl SlurmProvider usage for CU Alpine HPC
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    documentation enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    cytomining/CytoTable#179 ·

  • Explore pyarrow parquet write_dataset
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    cytomining/CytoTable#177 ·

  • Outline the best settings for Parsl configuration with CytoTable
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    cytomining/CytoTable#176 · コメント 7 件 · 担当者 1 名 ·

  • `WorkerLost: Task failure due to loss of worker` Failure during join data creation using HTE Parsl config with `SQ00014613.sqlite`
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    cytomining/CytoTable#169 ·

  • Address IN Carta data output when `concat=False`
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    cytomining/CytoTable#154 ·

  • Simplify data output to single directory or filepath
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 32/100

    cytomining/CytoTable#150 ·

  • Add data source filenames and directories to CytoTable metadata (or similar)
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    cytomining/CytoTable#149 ·

  • `parsl.jobs.errors.TooManyJobFailuresError` sporadically occurs on MacOS Images for GitHub Actions jobs during `pytest` operations
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    cytomining/CytoTable#143 · コメント 2 件 ·

  • Enable automatic `local_cache_dir` specification for cloud-based SQLite data sources
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    cytomining/CytoTable#140 ·

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。