possible documentation error for "sorting by channel group"
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 1/5
- Thời gian dự kiến
- Dưới một giờ
- Mức phù hợp với người mới
- 78/100
- Loại issue
- Tài liệu
- Độ rõ ràng
- Đặc tả rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Sôi nổi
- Công nghệ
- python
- Lĩnh vực
- documentation
Hướng nghiên cứu
Đọc mục “Sorting by channel group” trong how_to/process_by_channel_group.html và đối chiếu ví dụ chia thủ công với vòng lặp split_by("group"). Xác minh xem sorter có nên nhận sub_recording thay vì toàn bộ tập hợp bản ghi đã chia hay không; hoàn tất khi ví dụ xử lý từng nhóm như dự kiến và tài liệu phản ánh đúng hành vi đó.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Hi, sorry about all the issue reports and thanks again for Spikeinterface which is great!
I'm trying to sort a tetrode dataset so I was following the instructions here to sort by channel group.
My workflow is to run through the full process per tetrode so I can start manual refinement (with Phy) on each tetrode as its automated sorting is done. So I want to do "option 2: manual splitting" so I can then to the sorting analyzer and extraction to phy per tetrode.
The documentation says to do:
split_preprocessed_recording = preprocessed_recording.split_by("group")
sortings = {}
for group, sub_recording in split_preprocessed_recording.items():
sorting = run_sorter(
sorter_name='kilosort2',
recording=split_preprocessed_recording,
folder=f"folder_KS2_group{group}"
)
sortings[group] = sorting
I wonder if it shouldn't be recording = sub_recording in that loop instead? Otherwise 'sorting' seems to always contain all tetrodes.
Let me know if there's a better way to report issues about the documentation.
Thanks,
El.
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 859
- Fork
- 286
- Merge trung bình
- 3 ngày 16 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 52
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của SpikeInterface/spikeinterface
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
SpikeInterface/spikeinterface#4842 · 2 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
testing
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
SpikeInterface/spikeinterface#4756 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
enhancement
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
SpikeInterface/spikeinterface#4510 · 2 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
PCA fitting can overflow LAPACK's 32-bit indexing when fitting all spikesCó thể đã có người làm @kushaangupta đã nhận 4 ngày trước. Đang mởpostprocessing
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
SpikeInterface/spikeinterface#4868 · 1 reaction ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 8/100
SpikeInterface/spikeinterface#4860 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
Tất cả issue của SpikeInterface/spikeinterface
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 83/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 86/100
google-ai-edge/litert-torch#1346 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
geneontology/gocam-py#272 ·
-
pushed_authorization_request sends list authorization_details as a Python reprCó thể đã có người làm @RaphaelFakhri đã nhận hôm nay. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
auth0/auth0-python#903 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày