Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

juliacall: Julia GC triggered from a python thread causes hangs

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#578 3 bình luận 1 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
30/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
julia, python
Lĩnh vực
backend

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách chạy trình tái hiện Python threading được cung cấp với JuliaCall và kiểm tra các đường dẫn gọi của PythonCall JlWrap/any.jl và JlWrap/base.jl được hiển thị trong stack trace. So sánh hành vi khi bật và tắt Julia GC; hoàn tất khi lệnh gọi GC trong thread hoàn thành mà không bị treo trên các môi trường được báo cáo.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

bug

Affects: JuliaCall

Describe the bug
I am seeing Julia tasks launched from parallel python threads lead to sporadic hangs. Short-running tasks suffer less from this. I had no luck using the tricks from #539 or here. I think the hangs are triggered by Julia GC - disabling GC with Base.GC.enable(false) beforehand seems to fix the hangs - and triggering Julia GC manually from a python thread immediately causes a hang.

This is all with PYTHON_JULIACALL_HANDLE_SIGNALS set to yes, in case that matters.

from juliacall import Main as jl
jl_gc = jl.Base.GC.gc

import threading
t = threading.Thread(target=jl_gc)
t.start()  # hangs every time (100% CPU)

Terminating python gives me

[89363] signal (15): Terminated: 15
in expression starting at none:0
jl_gc_wait_for_the_world at /Users/julia/.julia/scratchspaces/a66863c6-20e8-4ff4-8a62-49f30b1f605e/agent-cache/default-honeycrisp-R17H3W25T9.0/build/default-honeycrisp-R17H3W25T9-0/julialang/julia-release-1-dot-10/src/gc.c:241 [inlined]
ijl_gc_collect at /Users/julia/.julia/scratchspaces/a66863c6-20e8-4ff4-8a62-49f30b1f605e/agent-cache/default-honeycrisp-R17H3W25T9.0/build/default-honeycrisp-R17H3W25T9-0/julialang/julia-release-1-dot-10/src/gc.c:3515
gc at ./gcutils.jl:129 [inlined]
gc at ./gcutils.jl:129 [inlined]
pyjlany_call at /Users/username/.julia/packages/PythonCall/Nr75f/src/JlWrap/any.jl:45
_jl_invoke at /Users/julia/.julia/scratchspaces/a66863c6-20e8-4ff4-8a62-49f30b1f605e/agent-cache/default-honeycrisp-R17H3W25T9.0/build/default-honeycrisp-R17H3W25T9-0/julialang/julia-release-1-dot-10/src/gf.c:0 [inlined]
ijl_apply_generic at /Users/julia/.julia/scratchspaces/a66863c6-20e8-4ff4-8a62-49f30b1f605e/agent-cache/default-honeycrisp-R17H3W25T9.0/build/default-honeycrisp-R17H3W25T9-0/julialang/julia-release-1-dot-10/src/gf.c:3077
(pyproj) c889f3b4c8d7:pyproj username$ _pyjl_callmethod at /Users/username/.julia/packages/PythonCall/Nr75f/src/JlWrap/base.jl:73
_pyjl_callmethod at /Users/username/.julia/packages/PythonCall/Nr75f/src/JlWrap/C.jl:63
jfptr__pyjl_callmethod_9032 at /Users/username/.julia/compiled/v1.10/PythonCall/WdXsa_v1O0R.dylib (unknown line)
_jl_invoke at /Users/julia/.julia/scratchspaces/a66863c6-20e8-4ff4-8a62-49f30b1f605e/agent-cache/default-honeycrisp-R17H3W25T9.0/build/default-honeycrisp-R17H3W25T9-0/julialang/julia-release-1-dot-10/src/gf.c:0 [inlined]
ijl_apply_generic at /Users/julia/.julia/scratchspaces/a66863c6-20e8-4ff4-8a62-49f30b1f605e/agent-cache/default-honeycrisp-R17H3W25T9.0/build/default-honeycrisp-R17H3W25T9-0/julialang/julia-release-1-dot-10/src/gf.c:3077
jlcapi__pyjl_callmethod_9116 at /Users/username/.julia/compiled/v1.10/PythonCall/WdXsa_v1O0R.dylib (unknown line)
method_vectorcall_VARARGS at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
PyObject_Vectorcall at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
_PyObject_FastCallDictTstate at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
slot_tp_call at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
_PyObject_Call at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
method_vectorcall at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
thread_run at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
pythread_wrapper at /Users/username/miniforge3/envs/pyproj/bin/python3.12 (unknown line)
_pthread_start at /usr/lib/system/libsystem_pthread.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
__psynch_cvwait at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
unknown function (ip: 0x0)
Allocations: 3689147 (Pool: 3684864; Big: 4283); GC: 6

Your system

  • MacOS, Apple Silicon, Julia 1.10.5
  • Linux, x86_64, Julia 1.10.6
  • PythonCall/juliacall 0.9.23
Ngôn ngữ chính
Julia
Star
1.1k
Fork
89
Merge trung bình
2 ngày 15 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
7

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của JuliaPy/PythonCall.jl

Tất cả issue của JuliaPy/PythonCall.jl

Issue tương tự

Thêm issue về Julia

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.