Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

julia PyPlot support missing data

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#593 2 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

@deszoeke đang làm issue này rồi.

Từ ngày 10/12/2024.

  • #596 của @deszoeke — đang mở

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
45/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
julia, python
Lĩnh vực
data-visualization

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu tại src/PyPlot.jl, quanh các điểm vào của plot ở các dòng 190-194 được hiển thị trong traceback, sau đó theo dõi cách các giá trị Julia được truyền qua PyCall đến matplotlib. Hoàn tất khi plot([0, missing, 2]) không còn gây ra lỗi đã báo cáo, các giá trị missing được bỏ qua giống như NaN và một cảnh báo ngắn được phát ra.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Passing a value of missing, a first class type in Julia Base, to matplotlib should simply not the plot missing data. It should handle missing just like it presently does NaN.

However, passing a missing to matplotlib results in long and unhelpful errors from PyPlot and matplotlib:

plot([0,missing,2])

ERROR: PyError ($(Expr(:escape, :(ccall(#= ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:43 =# @pysym(:PyObject_Call), PyPtr, (PyPtr, PyPtr, PyPtr), o, pyargsptr, kw))))) <class 'TypeError'>
TypeError("float() argument must be a string or a real number, not 'PyCall.jlwrap'")
  File "mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/pyplot.py", line 3794, in plot
    return gca().plot(
           ^^^^^^^^^^^
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/axes/_axes.py", line 1781, in plot
    self.add_line(line)
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/axes/_base.py", line 2339, in add_line
    self._update_line_limits(line)
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/axes/_base.py", line 2362, in _update_line_limits
    path = line.get_path()
           ^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/lines.py", line 1037, in get_path
    self.recache()
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/lines.py", line 679, in recache
    y = _to_unmasked_float_array(yconv).ravel()
        ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/cbook.py", line 1398, in _to_unmasked_float_array
    return np.asarray(x, float)
           ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

Stacktrace:
  [1] pyerr_check
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:75 [inlined]
  [2] pyerr_check
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:79 [inlined]
  [3] _handle_error(msg::String)
    @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:96
  [4] macro expansion
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:110 [inlined]
  [5] #107
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:43 [inlined]
  [6] disable_sigint
    @ ./c.jl:473 [inlined]
  [7] __pycall!
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:42 [inlined]
  [8] _pycall!(ret::PyObject, o::PyObject, args::Tuple{Vector{Union{Missing, Int64}}}, nargs::Int64, kw::Ptr{Nothing})
    @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:29
  [9] _pycall!
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:11 [inlined]
 [10] pycall
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:83 [inlined]
 [11] plot(args::Vector{Union{Missing, Int64}}; kws::@Kwargs{})
    @ PyPlot ~/.julia/packages/PyPlot/rWSdf/src/PyPlot.jl:194
 [12] plot(args::Vector{Union{Missing, Int64}})
    @ PyPlot ~/.julia/packages/PyPlot/rWSdf/src/PyPlot.jl:190
 [13] top-level scope
    @ REPL[56]:1

For years I have wrapped my inputs to matplotlib in the helper function

m2n(x) = ismissing(x) ? NaN : x

It is awkward.

I propose then, that

  1. missing values are simply (not) plotted, just like NaNs.
  2. a brief warning catch and warn the user of missings in the data.

The proposed change will make PyPlot more compatible with Julia and Plots.jl, cf.
https://github.com/JuliaPlots/Plots.jl/issues/1706

I expect this will not break most cases, because missing is just a newer use pattern than NaN for missing data.

Ngôn ngữ chính
Julia
Star
489
Fork
90
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của JuliaPy/PyPlot.jl

Tất cả issue của JuliaPy/PyPlot.jl

Issue tương tự

Thêm issue về Julia

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.