Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

julia PyPlot support missing data

Aperta
  • Qualcosa non va?
#593 2 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
julia, python
Ambito
data-visualization

Direzione di ricerca

Inizia da src/PyPlot.jl, nei pressi dei punti di ingresso di plot alle righe 190-194 mostrate nel traceback, quindi segui il modo in cui i valori Julia vengono passati a matplotlib tramite PyCall. Il lavoro è completato quando plot([0, missing, 2]) non genera più l'errore segnalato, i valori missing vengono omessi come NaN e viene emesso un breve avviso.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Passing a value of missing, a first class type in Julia Base, to matplotlib should simply not the plot missing data. It should handle missing just like it presently does NaN.

However, passing a missing to matplotlib results in long and unhelpful errors from PyPlot and matplotlib:

plot([0,missing,2])

ERROR: PyError ($(Expr(:escape, :(ccall(#= ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:43 =# @pysym(:PyObject_Call), PyPtr, (PyPtr, PyPtr, PyPtr), o, pyargsptr, kw))))) <class 'TypeError'>
TypeError("float() argument must be a string or a real number, not 'PyCall.jlwrap'")
  File "mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/pyplot.py", line 3794, in plot
    return gca().plot(
           ^^^^^^^^^^^
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/axes/_axes.py", line 1781, in plot
    self.add_line(line)
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/axes/_base.py", line 2339, in add_line
    self._update_line_limits(line)
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/axes/_base.py", line 2362, in _update_line_limits
    path = line.get_path()
           ^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/lines.py", line 1037, in get_path
    self.recache()
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/lines.py", line 679, in recache
    y = _to_unmasked_float_array(yconv).ravel()
        ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  File "/mypath/python3.12/site-packages/matplotlib/cbook.py", line 1398, in _to_unmasked_float_array
    return np.asarray(x, float)
           ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

Stacktrace:
  [1] pyerr_check
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:75 [inlined]
  [2] pyerr_check
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:79 [inlined]
  [3] _handle_error(msg::String)
    @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:96
  [4] macro expansion
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/exception.jl:110 [inlined]
  [5] #107
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:43 [inlined]
  [6] disable_sigint
    @ ./c.jl:473 [inlined]
  [7] __pycall!
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:42 [inlined]
  [8] _pycall!(ret::PyObject, o::PyObject, args::Tuple{Vector{Union{Missing, Int64}}}, nargs::Int64, kw::Ptr{Nothing})
    @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:29
  [9] _pycall!
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:11 [inlined]
 [10] pycall
    @ ~/.julia/packages/PyCall/1gn3u/src/pyfncall.jl:83 [inlined]
 [11] plot(args::Vector{Union{Missing, Int64}}; kws::@Kwargs{})
    @ PyPlot ~/.julia/packages/PyPlot/rWSdf/src/PyPlot.jl:194
 [12] plot(args::Vector{Union{Missing, Int64}})
    @ PyPlot ~/.julia/packages/PyPlot/rWSdf/src/PyPlot.jl:190
 [13] top-level scope
    @ REPL[56]:1

For years I have wrapped my inputs to matplotlib in the helper function

m2n(x) = ismissing(x) ? NaN : x

It is awkward.

I propose then, that

  1. missing values are simply (not) plotted, just like NaNs.
  2. a brief warning catch and warn the user of missings in the data.

The proposed change will make PyPlot more compatible with Julia and Plots.jl, cf.
https://github.com/JuliaPlots/Plots.jl/issues/1706

I expect this will not break most cases, because missing is just a newer use pattern than NaN for missing data.

Lingua principale
Julia
Stelle
488
Fork
90
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di JuliaPy/PyPlot.jl

Tutte le issue di JuliaPy/PyPlot.jl

Issue simili

Altre issue su Julia

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.