`InexactError` when trying to differentiate `ODEProblem` using `LabelledArrays`
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
Hướng nghiên cứu
Báo cáo chỉ đến recursive_unitless_bottom_eltype trong RecursiveArrayTools và init của ODEProblem; hãy bắt đầu bằng cách tái hiện phép so sánh LVector/Vector được cung cấp và lần theo stack trace vào cache Tsit5 của OrdinaryDiffEq. Hoàn thành khi lệnh gọi ForwardDiff.gradient cuối cùng hoàn tất mà không có InexactError, trong khi trường hợp Vector vẫn hoạt động.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
It looks like the source of the problem is that recursive_unitless_bottom_eltype from RecursiveArrayTools is inferring an Int64 type rather than a Float64 type from the Dual of a LabelledArray. This is happening somewhere inside ODEProblem's __init.
Note that this works fine if you switch from LVector to Vector for the parameter/initial-condition arrays.
using LabelledArrays
using ModelingToolkit
using DifferentialEquations
using ForwardDiff
pars = @parameters β α
@variables t E(t)
D = Differential(t)
eqs = [D(E) ~ α*t + β]
sys = ODESystem(eqs)
u0 = LVector(E = 1.0)
p = LVector(β = 0.8,
α = 0.75)
tspan = (0.0,1.0)
sys = structural_simplify(sys)
prob = ODEProblem(sys,u0,tspan,p)
function loss(inputs)
N = length(prob.p)
_p = inputs[1:N]
_u0 = inputs[N:end]
tmp_sol = solve(prob,Tsit5(),p=_p,u0=_u0,saveat=0.1)
sum(abs2,tmp_sol[E])
end
#Substitute a subset of the parameters/initial-conditions into the full set
inputter(par_vec) = LVector(β = p[1], α = par_vec[1], E = par_vec[2])
p0 = LVector(α = 1.0, E = 0.5)
dummy_loss(par_vec) = sum(abs2,par_vec)
ForwardDiff.gradient(x->dummy_loss(inputter(x)),p0) #works
ForwardDiff.gradient(dummy_loss,inputter(p0)) #Works
ForwardDiff.gradient(loss,inputter(p0)) #Works
ForwardDiff.gradient(x->loss(inputter(x)),p0) # Error
Error message:
ERROR: InexactError: Int64(161//1000)
Stacktrace:
[1] Integer
@ ./rational.jl:109 [inlined]
[2] convert(#unused#::Type{Int64}, x::Rational{Int64})
@ Base /Applications/Julia-1.6.app/Contents/Resources/julia/share/julia/base/number.jl:7
[3] OrdinaryDiffEq.Tsit5ConstantCache(T::Type, T2::Type)
@ OrdinaryDiffEq ~/.julia/packages/OrdinaryDiffEq/a5qvy/src/tableaus/low_order_rk_tableaus.jl:610
[4] alg_cache(alg::Tsit5, u::Vector{Real}, rate_prototype::Vector{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}}, uEltypeNoUnits::Type, uBottomEltypeNoUnits::Type, tTypeNoUnits::Type, uprev::Vector{Real}, uprev2::Vector{Real}, f::ODEFunction{true, ModelingToolkit.var"#f#165"{RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0xbabc66d3, 0x633a919b, 0xe4683138, 0x0e254e2d, 0x36925fe8)}, RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋out, :ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0x7eb6766a, 0x02a244e1, 0x54678655, 0x9f7f1370, 0x31962eb1)}}, LinearAlgebra.UniformScaling{Bool}, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Vector{Symbol}, Symbol, typeof(SciMLBase.DEFAULT_OBSERVED), Nothing}, t::Float64, dt::Float64, reltol::Vector{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}}, p::Vector{Real}, calck::Bool, #unused#::Val{true})
@ OrdinaryDiffEq ~/.julia/packages/OrdinaryDiffEq/a5qvy/src/caches/low_order_rk_caches.jl:348
[5] __init(prob::ODEProblem{Vector{Real}, Tuple{Float64, Float64}, true, Vector{Real}, ODEFunction{true, ModelingToolkit.var"#f#165"{RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0xbabc66d3, 0x633a919b, 0xe4683138, 0x0e254e2d, 0x36925fe8)}, RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋out, :ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0x7eb6766a, 0x02a244e1, 0x54678655, 0x9f7f1370, 0x31962eb1)}}, LinearAlgebra.UniformScaling{Bool}, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Vector{Symbol}, Symbol, typeof(SciMLBase.DEFAULT_OBSERVED), Nothing}, Base.Iterators.Pairs{Union{}, Union{}, Tuple{}, NamedTuple{(), Tuple{}}}, SciMLBase.StandardODEProblem}, alg::Tsit5, timeseries_init::Tuple{}, ts_init::Tuple{}, ks_init::Tuple{}, recompile::Type{Val{true}}; saveat::Float64, tstops::Tuple{}, d_discontinuities::Tuple{}, save_idxs::Nothing, save_everystep::Bool, save_on::Bool, save_start::Bool, save_end::Nothing, callback::Nothing, dense::Bool, calck::Bool, dt::Float64, dtmin::Nothing, dtmax::Float64, force_dtmin::Bool, adaptive::Bool, gamma::Rational{Int64}, abstol::Nothing, reltol::Nothing, qmin::Rational{Int64}, qmax::Int64, qsteady_min::Int64, qsteady_max::Int64, beta1::Nothing, beta2::Nothing, qoldinit::Rational{Int64}, controller::Nothing, fullnormalize::Bool, failfactor::Int64, maxiters::Int64, internalnorm::typeof(DiffEqBase.ODE_DEFAULT_NORM), internalopnorm::typeof(LinearAlgebra.opnorm), isoutofdomain::typeof(DiffEqBase.ODE_DEFAULT_ISOUTOFDOMAIN), unstable_check::typeof(DiffEqBase.ODE_DEFAULT_UNSTABLE_CHECK), verbose::Bool, timeseries_errors::Bool, dense_errors::Bool, advance_to_tstop::Bool, stop_at_next_tstop::Bool, initialize_save::Bool, progress::Bool, progress_steps::Int64, progress_name::String, progress_message::typeof(DiffEqBase.ODE_DEFAULT_PROG_MESSAGE), userdata::Nothing, allow_extrapolation::Bool, initialize_integrator::Bool, alias_u0::Bool, alias_du0::Bool, initializealg::OrdinaryDiffEq.DefaultInit, kwargs::Base.Iterators.Pairs{Union{}, Union{}, Tuple{}, NamedTuple{(), Tuple{}}})
@ OrdinaryDiffEq ~/.julia/packages/OrdinaryDiffEq/a5qvy/src/solve.jl:295
[6] __solve(::ODEProblem{Vector{Real}, Tuple{Float64, Float64}, true, Vector{Real}, ODEFunction{true, ModelingToolkit.var"#f#165"{RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0xbabc66d3, 0x633a919b, 0xe4683138, 0x0e254e2d, 0x36925fe8)}, RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋out, :ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0x7eb6766a, 0x02a244e1, 0x54678655, 0x9f7f1370, 0x31962eb1)}}, LinearAlgebra.UniformScaling{Bool}, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Vector{Symbol}, Symbol, typeof(SciMLBase.DEFAULT_OBSERVED), Nothing}, Base.Iterators.Pairs{Union{}, Union{}, Tuple{}, NamedTuple{(), Tuple{}}}, SciMLBase.StandardODEProblem}, ::Tsit5; kwargs::Base.Iterators.Pairs{Symbol, Float64, Tuple{Symbol}, NamedTuple{(:saveat,), Tuple{Float64}}})
@ OrdinaryDiffEq ~/.julia/packages/OrdinaryDiffEq/a5qvy/src/solve.jl:4
[7] solve_call(_prob::ODEProblem{Vector{Real}, Tuple{Float64, Float64}, true, Vector{Real}, ODEFunction{true, ModelingToolkit.var"#f#165"{RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0xbabc66d3, 0x633a919b, 0xe4683138, 0x0e254e2d, 0x36925fe8)}, RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋out, :ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0x7eb6766a, 0x02a244e1, 0x54678655, 0x9f7f1370, 0x31962eb1)}}, LinearAlgebra.UniformScaling{Bool}, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Vector{Symbol}, Symbol, typeof(SciMLBase.DEFAULT_OBSERVED), Nothing}, Base.Iterators.Pairs{Union{}, Union{}, Tuple{}, NamedTuple{(), Tuple{}}}, SciMLBase.StandardODEProblem}, args::Tsit5; merge_callbacks::Bool, kwargs::Base.Iterators.Pairs{Symbol, Float64, Tuple{Symbol}, NamedTuple{(:saveat,), Tuple{Float64}}})
@ DiffEqBase ~/.julia/packages/DiffEqBase/oe7VF/src/solve.jl:61
[8] solve_up(prob::ODEProblem{Vector{Float64}, Tuple{Float64, Float64}, true, Vector{Float64}, ODEFunction{true, ModelingToolkit.var"#f#165"{RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0xbabc66d3, 0x633a919b, 0xe4683138, 0x0e254e2d, 0x36925fe8)}, RuntimeGeneratedFunctions.RuntimeGeneratedFunction{(:ˍ₋out, :ˍ₋arg1, :ˍ₋arg2, :t), ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", ModelingToolkit.var"#_RGF_ModTag", (0x7eb6766a, 0x02a244e1, 0x54678655, 0x9f7f1370, 0x31962eb1)}}, LinearAlgebra.UniformScaling{Bool}, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Nothing, Vector{Symbol}, Symbol, typeof(SciMLBase.DEFAULT_OBSERVED), Nothing}, Base.Iterators.Pairs{Union{}, Union{}, Tuple{}, NamedTuple{(), Tuple{}}}, SciMLBase.StandardODEProblem}, sensealg::Nothing, u0::Vector{Real}, p::Vector{Real}, args::Tsit5; kwargs::Base.Iterators.Pairs{Symbol, Float64, Tuple{Symbol}, NamedTuple{(:saveat,), Tuple{Float64}}})
@ DiffEqBase ~/.julia/packages/DiffEqBase/oe7VF/src/solve.jl:82
[9] #solve#59
@ ~/.julia/packages/DiffEqBase/oe7VF/src/solve.jl:70 [inlined]
[10] loss(inputs::LArray{Real, 1, Vector{Real}, (:β, :α, :E)})
@ Main ./REPL[227]:5
[11] (::var"#65#66")(x::LArray{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}, 1, Vector{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}}, (:α, :E)})
@ Main ./REPL[234]:1
[12] vector_mode_dual_eval
@ ~/.julia/packages/ForwardDiff/QOqCN/src/apiutils.jl:37 [inlined]
[13] vector_mode_gradient(f::var"#65#66", x::LArray{Float64, 1, Vector{Float64}, (:α, :E)}, cfg::ForwardDiff.GradientConfig{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2, LArray{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}, 1, Vector{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}}, (:α, :E)}})
@ ForwardDiff ~/.julia/packages/ForwardDiff/QOqCN/src/gradient.jl:106
[14] gradient(f::Function, x::LArray{Float64, 1, Vector{Float64}, (:α, :E)}, cfg::ForwardDiff.GradientConfig{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2, LArray{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}, 1, Vector{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}}, (:α, :E)}}, ::Val{true})
@ ForwardDiff ~/.julia/packages/ForwardDiff/QOqCN/src/gradient.jl:19
[15] gradient(f::Function, x::LArray{Float64, 1, Vector{Float64}, (:α, :E)}, cfg::ForwardDiff.GradientConfig{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2, LArray{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}, 1, Vector{ForwardDiff.Dual{ForwardDiff.Tag{var"#65#66", Float64}, Float64, 2}}, (:α, :E)}}) (repeats 2 times)
@ ForwardDiff ~/.julia/packages/ForwardDiff/QOqCN/src/gradient.jl:17
[16] top-level scope
@ REPL[234]:1
- Ngôn ngữ chính
- Julia
- Star
- 1k
- Fork
- 162
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của JuliaDiff/ForwardDiff.jl
-
missing floatmin, floatmax, and issubnormal for DualCó thể đã có người làm @devmotion đã nhận 15 ngày trước. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
JuliaDiff/ForwardDiff.jl#852 · 6 bình luận ·
-
`fma` and `muladd` ignore NaN-safe modeCó thể đã có người làm @devmotion đã nhận hôm nay. Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100
JuliaDiff/ForwardDiff.jl#860 ·
-
Enable NaN-safe mode by defaultCó thể đã có người làm @devmotion đã nhận 2 ngày trước. Đang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
JuliaDiff/ForwardDiff.jl#857 · 1 reaction ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100
JuliaDiff/ForwardDiff.jl#854 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 75/100
JuliaDiff/ForwardDiff.jl#849 ·
Tất cả issue của JuliaDiff/ForwardDiff.jl
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
SciML/OrdinaryDiffEq.jl#4875 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 3 ngày
-
documentation
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 62/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 66/100
SciML/NonlinearSolve.jl#1372 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Truncated discrete ccdf and logccdf return incorrect values at the lower atomCó thể đã có người làm Có pull request liên kết đang mở hoặc đã được merge. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
JuliaStats/Distributions.jl#2095 ·
-
documentation 📜 microphysics💧 ❄️
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 63/100
NumericalEarth/Breeze.jl#1073 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày