Use BlueGraph on Connectome Analysis

Đang mở
#100 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
5/5
Thời gian dự kiến
Hơn một tuần
Mức phù hợp với người mới
15/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
neo4j, python
Lĩnh vực
backend-api-design, data-visualization

Hướng nghiên cứu

Không có tệp, bài kiểm thử hoặc điểm vào nào được nêu. Trước tiên, hãy làm rõ liệu yêu cầu này là về trực quan hóa đồ thị, tích hợp Python, hỗ trợ Neo4j hay phân tích mô phỏng, sau đó xác định các điểm vào liên quan của BlueGraph. Issue không xác định điều kiện hoàn thành có thể kiểm thử cho đề xuất rộng này.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Hello BlueGraph Team,

I was working on BBP circuits via representing them as graph, analyzing the motifs but couldnt find a way to visualize these dense graphs. Then I came across this platform thanks to Cyrille Favreau. Is there a jira project assigned to this ?

So far i have used networkx and igraph (more scalable as i was told) to analyses. but mostly I store my graph in adjacency matrix format and do operations on scipy.sparse module. I started to use Neo4j but the syntax is a bit annoying. So making a python backend would be very nice and scalable when we integrate it to bluegraph

Here are my projects if i can have a nice UI for the graph:

  1. Utilize 5th floor screen, open deck to visualize the graph to do lots of cool stuff
  2. Connect it to python scripts we already have.
  3. Make novel and visualization-based simulation analyses. See VIZTM-860, and also this cool company's work and demo video https://cambridge-intelligence.com/products/ on static and dynamic analyses of graph data.

Since we have this software and brain is a graph, i say lets use it on it :)

All the best,
Kerem

Ngôn ngữ chính
Python
Star
34
Fork
5
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của BlueBrain/BlueGraph

Tất cả issue của BlueBrain/BlueGraph

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.