Use BlueGraph on Connectome Analysis

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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
15/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
neo4j, python
Ambito
backend-api-design, data-visualization

Direzione di ricerca

Non viene indicato alcun file, test o punto di ingresso. Inizia chiarendo se la richiesta riguarda la visualizzazione di grafi, l'integrazione con Python, il supporto per Neo4j o l'analisi delle simulazioni, quindi identifica i punti di ingresso pertinenti di BlueGraph. L'issue non definisce una condizione di completamento verificabile per questa proposta ampia.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Hello BlueGraph Team,

I was working on BBP circuits via representing them as graph, analyzing the motifs but couldnt find a way to visualize these dense graphs. Then I came across this platform thanks to Cyrille Favreau. Is there a jira project assigned to this ?

So far i have used networkx and igraph (more scalable as i was told) to analyses. but mostly I store my graph in adjacency matrix format and do operations on scipy.sparse module. I started to use Neo4j but the syntax is a bit annoying. So making a python backend would be very nice and scalable when we integrate it to bluegraph

Here are my projects if i can have a nice UI for the graph:

  1. Utilize 5th floor screen, open deck to visualize the graph to do lots of cool stuff
  2. Connect it to python scripts we already have.
  3. Make novel and visualization-based simulation analyses. See VIZTM-860, and also this cool company's work and demo video https://cambridge-intelligence.com/products/ on static and dynamic analyses of graph data.

Since we have this software and brain is a graph, i say lets use it on it :)

All the best,
Kerem

Lingua principale
Python
Stelle
34
Fork
5
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Apri la guida per i contributori

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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