Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Loading an (arbitrary) package slows down bplapply()

Đang mở
#47 1 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
25/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
r
Lĩnh vực
hpc

Hướng nghiên cứu

Start by reproducing the two bplapply() benchmarks with MulticoreParam and compare timings before and after loading mgcv. The issue names no files or tests, so trace the bplapply()/MulticoreParam execution path to identify where package loading affects the slowdown. Done should include a verified explanation and a regression check for the reported timing difference.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

2.5x longer when mgcv is loaded.

> library(BiocParallel)
> system.time(bplapply(1:1e2 , function(...) {}, BPPARAM = MulticoreParam(workers = 2, tasks=1e2)))
   user  system elapsed 
  0.089   0.008   5.832 
> library(mgcv)
Loading required package: nlme
This is mgcv 1.8-10. For overview type 'help("mgcv-package")'.
> system.time(bplapply(1:1e2 , function(...) {}, BPPARAM = MulticoreParam(workers = 2, tasks=1e2)))
   user  system elapsed 
  0.095   0.012  12.048
Ngôn ngữ chính
R
Star
69
Fork
32
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của Bioconductor/BiocParallel

Tất cả issue của Bioconductor/BiocParallel

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.