Support for PEtab 2.0
@PaulJonasJost já está trabalhando nisso.
Desde 2/7/2026.
Avaliação
Esta issue ainda não foi avaliada.
Descrição
It would be great if PEtab-GUI would support PEtab 2.0, ideally, for now, in parallel to 1.0.
This will require quite a few changes (new tables, different object model, changed columns, no visualization table for now). Ideally, the model would operate directly on the underlying petab pydantic objects, not the dataframes. Updating the pydantic objects directly will provide more specific error messages.
To break that into more manageable chunks, one could start with only simple problems: SBML model, no mapping table, no experiment and condition table.
- Linguagem predominante
- Python
- Estrelas
- 6
- Forks
- 1
- Métricas de merge de PRs
- Nenhum PR com merge em 30d
Preparar o ambiente
Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
Mais de PEtab-dev/PEtab-GUI
-
Testability and Further ModularizationTalvez livre de novo @PaulJonasJost assumiu há 208 dias e não há nenhum pull request aberto. Abertahelp wanted improvement WIP
-
enhancement
Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100
-
Minor issues when saving fileTalvez livre de novo @PaulJonasJost assumiu há 248 dias e não há nenhum pull request aberto. Abertabug enhancement
-
Bug in Observable TableAberta
Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100
-
Intelligent Default PlottingAbertaenhancement
Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100
Todas as issues de PEtab-dev/PEtab-GUI
Issues semelhantes
-
tests: pin that the atomic writers in utils/paths.py stage the temporary file in the target's directoryTalvez já em andamento Um pull request vinculado a esta issue está aberto ou já foi mesclado. Abertadifficulty:2 enhancement good first issue
Dificuldade 1/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 92/100
MakazhanAlpamys/Soup#2178 ·
Mantenedores costumam responder em até 1 dia
-
Slang input: int8_t4_packed and uint8_t4_packed are copied into CrossGLTalvez já em andamento @ninglinLiu assumiu hoje. Abertaarea:frontend backend:slang bug direction:input
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 70/100
Mantenedores costumam responder em até 1 dia
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 85/100
Mantenedores costumam responder em até 13 dias
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 85/100
Kozea/Radicale#2301 · 2 comentários ·
Mantenedores costumam responder em até 1 dia
-
bug ci good first issue
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 88/100
Mantenedores costumam responder em até 1 dia