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Support for PEtab 2.0

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@PaulJonasJost y travaille déjà.

Depuis le 2/7/2026.

Évaluation

Cette issue n'a pas encore été évaluée.

Description

enhancement

It would be great if PEtab-GUI would support PEtab 2.0, ideally, for now, in parallel to 1.0.

This will require quite a few changes (new tables, different object model, changed columns, no visualization table for now). Ideally, the model would operate directly on the underlying petab pydantic objects, not the dataframes. Updating the pydantic objects directly will provide more specific error messages.

To break that into more manageable chunks, one could start with only simple problems: SBML model, no mapping table, no experiment and condition table.

Langage dominant
Python
Étoiles
6
Forks
1
Aucune PR mergée en 30 j

Préparer son environnement

Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

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