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Unable to import Python module

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Avaliação

Dificuldade
3/5
Tempo estimado
1-2 dias
Facilidade para iniciantes
35/100
Tipo de issue
Bug
Clareza
Precisa de esclarecimento
Status de atividade
Pouca atividade
Stack de tecnologia
python
Domínio
tooling

Direção de pesquisa

Comece com LHIPA.py e o programa Julia mostrado na issue e, em seguida, reproduza o ModuleNotFoundError no ambiente PythonCall exibido. Compare o sys.path informado e as distribuições instaladas com a tentativa de importação; o trabalho estará concluído quando for identificado se o responsável é o PythonCall ou a importação do módulo/pacote e uma resolução verificada for documentada.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

question

To be honest, I'm a little perplexed at how this is failing.

For a background, I need to import a python file that I wrote and is stored in the local directory (LHIPA.py). That file, in turn, needs to import PyWavelets, which has been installed in the .Condapkg environment. I have confirmed in my Julia program as well as in the python file that it is using the python environment created by PythonCall.jl. I've also confirmed, in the Python program, that PyWavelets is an installed package, yet I get this error message: ERROR: Python: ModuleNotFoundError: No module named 'pywavelets'

First the Julia program as well as its output:

...

ENV["JULIA_CONDAPKG_BACKEND"] = "Null"
ENV["JULIA_PYTHONCALL_EXE"] = raw"/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11'"

using PythonCall
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")
println("\n PythonCall is using", PythonCall.python_executable_path())
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")

 pth = (@__DIR__)        # Path where the python routines are
 pyimport("sys").path.append(pth)  # append path

println("sys.path = ", pyimport("sys").path)
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")
println("ENV['JULIA_CONDAPKG_BACKEND']  = ", ENV["JULIA_CONDAPKG_BACKEND"] )
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")
println("ENV['JULIA_PYTHONCALL_EXE']  = ", ENV["JULIA_PYTHONCALL_EXE"] )

LH = pyimport("LHIPA")

And the output looks as expected:

PythonCall is using/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/bin/python
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
sys.path = ['/Users/MattPetersonsAccount/.julia/packages/PythonCall/83z4q/pysrc', 
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python311.zip', 
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11', 
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11/lib-dynload', 
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11/site-packages', 
'/Users/MattPetersonsAccount/Documents/Development/PsychoPy/Spatial n-back 2']
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
ENV['JULIA_CONDAPKG_BACKEND']  = Null
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
ENV['JULIA_PYTHONCALL_EXE']  = /Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11'

The Python file, LHIPA.py, looks like this:

from platform import python_version
print("LHIPA python version is: ",python_version())

import importlib_metadata
dists = importlib_metadata.distributions()
for dist in dists:
    name = dist.metadata["Name"]
    version = dist.version
    print(f'found distribution {name}=={version}')
import sys
print("\n",sys.prefix,"\n")

import math
import PyWavelets

And again, the output is as expected:

LHIPA python version is:  3.11.0
found distribution setuptools==82.0.1
found distribution wheel==0.46.3
found distribution importlib_metadata==8.7.1
found distribution pip==26.0.1
found distribution packaging==26.0
found distribution numpy==2.4.4
found distribution PyWavelets==1.9.0
found distribution zipp==3.23.0

 /Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default

So, I've confirmed that Julia and Python are using the same environment (unless one of them is reporting incorrectly, or there is an error in front of my eyes I am missing) and I've confirmed that PyWavelets in the Python environment. Yet, I get an import error.

Any ideas? Is there something blatantly obvious that I'm missing?

Linguagem predominante
Julia
Estrelas
1.1k
Forks
89
Merge médio
2d 15h
PRs com merge (30d)
7

Preparar o ambiente

Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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