Unable to import Python module
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
まだ誰も着手していません。
評価
調査の方向性
LHIPA.py と issue に示されている Julia プログラムから始め、表示されている PythonCall 環境で ModuleNotFoundError を再現します。報告されている sys.path とインストール済みディストリビューションを import の試行と比較します。PythonCall とモジュール/package の import のどちらに原因があるかを特定し、検証済みの解決策を文書化できれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
To be honest, I'm a little perplexed at how this is failing.
For a background, I need to import a python file that I wrote and is stored in the local directory (LHIPA.py). That file, in turn, needs to import PyWavelets, which has been installed in the .Condapkg environment. I have confirmed in my Julia program as well as in the python file that it is using the python environment created by PythonCall.jl. I've also confirmed, in the Python program, that PyWavelets is an installed package, yet I get this error message: ERROR: Python: ModuleNotFoundError: No module named 'pywavelets'
First the Julia program as well as its output:
...
ENV["JULIA_CONDAPKG_BACKEND"] = "Null"
ENV["JULIA_PYTHONCALL_EXE"] = raw"/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11'"
using PythonCall
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")
println("\n PythonCall is using", PythonCall.python_executable_path())
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")
pth = (@__DIR__) # Path where the python routines are
pyimport("sys").path.append(pth) # append path
println("sys.path = ", pyimport("sys").path)
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")
println("ENV['JULIA_CONDAPKG_BACKEND'] = ", ENV["JULIA_CONDAPKG_BACKEND"] )
println("~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~")
println("ENV['JULIA_PYTHONCALL_EXE'] = ", ENV["JULIA_PYTHONCALL_EXE"] )
LH = pyimport("LHIPA")
And the output looks as expected:
PythonCall is using/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/bin/python
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
sys.path = ['/Users/MattPetersonsAccount/.julia/packages/PythonCall/83z4q/pysrc',
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python311.zip',
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11',
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11/lib-dynload',
'/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11/site-packages',
'/Users/MattPetersonsAccount/Documents/Development/PsychoPy/Spatial n-back 2']
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
ENV['JULIA_CONDAPKG_BACKEND'] = Null
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
ENV['JULIA_PYTHONCALL_EXE'] = /Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default/lib/python3.11'
The Python file, LHIPA.py, looks like this:
from platform import python_version
print("LHIPA python version is: ",python_version())
import importlib_metadata
dists = importlib_metadata.distributions()
for dist in dists:
name = dist.metadata["Name"]
version = dist.version
print(f'found distribution {name}=={version}')
import sys
print("\n",sys.prefix,"\n")
import math
import PyWavelets
And again, the output is as expected:
LHIPA python version is: 3.11.0
found distribution setuptools==82.0.1
found distribution wheel==0.46.3
found distribution importlib_metadata==8.7.1
found distribution pip==26.0.1
found distribution packaging==26.0
found distribution numpy==2.4.4
found distribution PyWavelets==1.9.0
found distribution zipp==3.23.0
/Users/MattPetersonsAccount/.julia/environments/v1.11/.CondaPkg/.pixi/envs/default
So, I've confirmed that Julia and Python are using the same environment (unless one of them is reporting incorrectly, or there is an error in front of my eyes I am missing) and I've confirmed that PyWavelets in the Python environment. Yet, I get an import error.
Any ideas? Is there something blatantly obvious that I'm missing?
- 主要言語
- Julia
- スター
- 1.1k
- フォーク
- 89
- 平均マージ
- 2日 15時間
- マージ済み PR（30日）
- 7
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
JuliaPy/PythonCall.jl のほかの issue
-
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100
JuliaPy/PythonCall.jl#828 · コメント 7 件 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
bug
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100
JuliaPy/PythonCall.jl#809 · コメント 2 件 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
enhancement
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
JuliaPy/PythonCall.jl#805 · コメント 4 件 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
enhancement
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 68/100
JuliaPy/PythonCall.jl#796 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
enhancement
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100
JuliaPy/PythonCall.jl#790 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
JuliaPy/PythonCall.jl の issue をすべて見る
似ている issue
-
bug
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 62/100
SciML/ModelingToolkitStandardLibrary.jl#529 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 60/100
EnzymeAD/ReactantServer.jl#103 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100
ClapeyronThermo/Clapeyron.jl#649 ·
-
documentation
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 62/100
ohno/Antique.jl#165 ·
-
`UnitLowerTriangular(transpose(M')) \ b` returns a wrong solution対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープン
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 78/100
JuliaLang/LinearAlgebra.jl#1749 ·
メンテナーはふだん 2 日以内に返信