Inference
Ninguém assumiu esta issue ainda.
Avaliação
- Dificuldade
- 4/5
- Tempo estimado
- 3-5 dias
- Facilidade para iniciantes
- 45/100
- Tipo de issue
- Funcionalidade
- Clareza
- Precisa de esclarecimento
- Status de atividade
- Ativa
- Stack de tecnologia
- python
- Domínio
- bioinformatics, machine-learning
Direção de pesquisa
Comece localizando o modelo ajustado com fine-tuning em Tahoe e qualquer ponto de entrada de inferência existente; em seguida, inspecione como as matrizes de expressão gênica de controle e as perturbações de medicamentos são representadas. Defina um notebook que aceite a matriz de controle de um usuário, aplique o modelo e demonstre a previsão da matriz de expressão das células perturbadas.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
Thanks for the work!
How can I use your model finetuned on tahoe for instance to predict the gene expression matrix of cells perturbed by a drug given my own gene expression matrix of control cells? That would a very useful notebook to have :).
Raf
- Linguagem predominante
- Python
- Estrelas
- 63
- Forks
- 10
- Métricas de merge de PRs
- Nenhum PR com merge em 30d
Preparar o ambiente
Ainda não verificamos os arquivos de configuração deste projeto. Comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
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