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DReichLab

4 repositórios indexados · Ver no GitHub

AdmixTools
Tools test whether admixture occurred and more

C · 235 estrelas
EIG
Eigen tools by Nick Patterson and Alkes Price lab

C · 207 estrelas
ADNA-Tools
This project is a collection of tools for bioinformatic processing of ancient DNA data at the Harvard Medical School Reich Lab.

Java · 30 estrelas
waldo

Python · 3 estrelas

Para iniciantes Tudo

Abertas Todas

Skeletal element category cannot be updated to empty in sample archaeology update form Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 82/100

DReichLab/waldo#300 · Aberta em 16/7/2026
genetic_analysis_new results for controls Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 55/100

DReichLab/waldo#299 · Aberta em 25/6/2026
Add Coverage Field to Sample Site Updater Upload Template Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 68/100

DReichLab/waldo#298 · Aberta em 18/6/2026
single-stranded index hopping warnings Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#297 · Aberta em 11/6/2026
Questions regarding D-statistic calculation with qpDstat in ADMIXTURE Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/AdmixTools#125 · 7 comentários · Aberta em 14/5/2026
Powder samples and powder batch after reassignment Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#296 · Aberta em 29/4/2026
Picard MarkDuplicates barcodes Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

DReichLab/ADNA-Tools#8 · Aberta em 27/4/2026
Assessments: provisional Aberta

question

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#294 · Aberta em 10/4/2026
Genetic ID uniqueness constraint's effect on genetic ID updates Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 42/100

DReichLab/waldo#293 · Aberta em 9/4/2026
Archaeological Assemblage uniqueness Aberta

archaeology

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

DReichLab/waldo#290 · Aberta em 9/4/2026
S-IDs duplicated in Powder Batches Aberta

bug

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 38/100

DReichLab/waldo#288 · Aberta em 30/3/2026
Publications by DataInstance instead of GeneticAnalysis Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#286 · Aberta em 30/3/2026
ENA entries by publication? Aberta

question

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#285 · Aberta em 30/3/2026
Genetic ID consistency with publication labels Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

DReichLab/waldo#284 · Aberta em 27/3/2026
Publication bibtex field Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 55/100

DReichLab/waldo#283 · Aberta em 26/3/2026
direct ROH Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

DReichLab/waldo#281 · Aberta em 12/3/2026
Publication should be unique for genetic ID? Aberta

archaeology

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 42/100

DReichLab/waldo#280 · Aberta em 9/3/2026
show lost lysate with "lost" batch Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100

DReichLab/waldo#278 · Aberta em 2/3/2026
Powder batches do not show all powders Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#277 · 1 comentário · Aberta em 20/2/2026
Non-bam-analysis-related annotations not in database Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

DReichLab/waldo#276 · 1 comentário · Aberta em 19/2/2026
Batch upload form for sites / periods / cultures Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#272 · Aberta em 19/2/2026
No way to assign representative contacts for external data in WALDO Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 38/100

DReichLab/waldo#271 · 1 comentário · Aberta em 19/2/2026
Sample powder remaining batch command Aberta

DReichLab/waldo#265 · 3 comentários · 1 responsável · Aberta em 9/2/2026
Publication for temporarily anonymized samples Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

DReichLab/waldo#263 · 1 comentário · Aberta em 5/2/2026
Sample special restrictions Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 42/100

DReichLab/waldo#262 · Aberta em 4/2/2026
Paging samples does not preserve search GET parameters Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#261 · Aberta em 2/2/2026
No Well ID Preventing Editing Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#259 · 3 comentários · Aberta em 21/1/2026
Relationships in annotation Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#258 · Aberta em 4/1/2026
Tracking of Samples Sent Out of Lab or Used Up Aberta

enhancement

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

DReichLab/waldo#252 · 1 comentário · Aberta em 8/12/2025
Powder Batches Are Missing In WALDO Aberta

Urgent

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DReichLab/waldo#250 · 2 comentários · Aberta em 3/12/2025
Unique FluidX barcodes across lysates and libraries Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#249 · Aberta em 2/12/2025
questions about qpDstat Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DReichLab/AdmixTools#123 · 2 comentários · Aberta em 18/11/2025
Question about extremely high Z-scores (Z = 100) in qpDstat results Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

DReichLab/AdmixTools#122 · 2 comentários · Aberta em 5/11/2025
Question about “duplicate in list” error and memory usage when running qpDstat Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DReichLab/AdmixTools#121 · 1 comentário · Aberta em 4/11/2025
Anno file reports multiple samples Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#245 · Aberta em 30/10/2025
individual table Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#242 · Aberta em 27/10/2025
multiple collaborators per sample Aberta

waiting

DReichLab/waldo#238 · 1 comentário · 1 responsável · Aberta em 6/10/2025
Question Regarding SNP Count After Merging Genotype Files Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DReichLab/EIG#114 · 1 comentário · Aberta em 29/9/2025
catch newlines in validation Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#233 · Aberta em 26/9/2025
DS no barcode only index alert Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#232 · Aberta em 8/9/2025
Results with wrong plate pointers Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 38/100

DReichLab/waldo#231 · Aberta em 14/8/2025
F2 utility in admixtools? Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

DReichLab/AdmixTools#117 · 3 comentários · Aberta em 26/7/2025
external extracts/libraries material accounting Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#227 · Aberta em 10/7/2025
individual ID, sample pointers Aberta

DReichLab/waldo#225 · 1 comentário · 1 responsável · Aberta em 26/6/2025
links from sample dates to periods, cultures, etc. Aberta

archaeology

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 45/100

DReichLab/waldo#222 · Aberta em 26/6/2025
Undefined behavior in PACKEDANCESTRYMAP hash code Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 48/100

DReichLab/EIG#113 · 1 comentário · Aberta em 19/6/2025
non-human samples Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 38/100

DReichLab/waldo#218 · Aberta em 12/6/2025
Renaming batches Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

DReichLab/waldo#210 · Aberta em 22/4/2025
Library batch add extracts Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 42/100

DReichLab/waldo#209 · Aberta em 22/4/2025
How is estimated the genetic distance Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 20/100

DReichLab/EIG#112 · Aberta em 22/4/2025

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