Propietario

DReichLab

4 repositorios indexados · Ver en GitHub

AdmixTools
Tools test whether admixture occurred and more

C · 235 estrellas
EIG
Eigen tools by Nick Patterson and Alkes Price lab

C · 207 estrellas
ADNA-Tools
This project is a collection of tools for bioinformatic processing of ancient DNA data at the Harvard Medical School Reich Lab.

Java · 30 estrellas
waldo

Python · 3 estrellas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

Skeletal element category cannot be updated to empty in sample archaeology update form Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 82/100

DReichLab/waldo#300 · Abierto el 16/7/2026
genetic_analysis_new results for controls Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

DReichLab/waldo#299 · Abierto el 25/6/2026
Add Coverage Field to Sample Site Updater Upload Template Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 68/100

DReichLab/waldo#298 · Abierto el 18/6/2026
single-stranded index hopping warnings Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#297 · Abierto el 11/6/2026
Questions regarding D-statistic calculation with qpDstat in ADMIXTURE Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/AdmixTools#125 · 7 comentarios · Abierto el 14/5/2026
Powder samples and powder batch after reassignment Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#296 · Abierto el 29/4/2026
Picard MarkDuplicates barcodes Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

DReichLab/ADNA-Tools#8 · Abierto el 27/4/2026
Assessments: provisional Abierto

question

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#294 · Abierto el 10/4/2026
Genetic ID uniqueness constraint's effect on genetic ID updates Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

DReichLab/waldo#293 · Abierto el 9/4/2026
Archaeological Assemblage uniqueness Abierto

archaeology

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

DReichLab/waldo#290 · Abierto el 9/4/2026
S-IDs duplicated in Powder Batches Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

DReichLab/waldo#288 · Abierto el 30/3/2026
Publications by DataInstance instead of GeneticAnalysis Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#286 · Abierto el 30/3/2026
ENA entries by publication? Abierto

question

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#285 · Abierto el 30/3/2026
Genetic ID consistency with publication labels Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

DReichLab/waldo#284 · Abierto el 27/3/2026
Publication bibtex field Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

DReichLab/waldo#283 · Abierto el 26/3/2026
direct ROH Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

DReichLab/waldo#281 · Abierto el 12/3/2026
Publication should be unique for genetic ID? Abierto

archaeology

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

DReichLab/waldo#280 · Abierto el 9/3/2026
show lost lysate with "lost" batch Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

DReichLab/waldo#278 · Abierto el 2/3/2026
Powder batches do not show all powders Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#277 · 1 comentario · Abierto el 20/2/2026
Non-bam-analysis-related annotations not in database Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

DReichLab/waldo#276 · 1 comentario · Abierto el 19/2/2026
Batch upload form for sites / periods / cultures Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#272 · Abierto el 19/2/2026
No way to assign representative contacts for external data in WALDO Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

DReichLab/waldo#271 · 1 comentario · Abierto el 19/2/2026
Sample powder remaining batch command Abierto

DReichLab/waldo#265 · 3 comentarios · 1 asignado · Abierto el 9/2/2026
Publication for temporarily anonymized samples Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

DReichLab/waldo#263 · 1 comentario · Abierto el 5/2/2026
Sample special restrictions Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

DReichLab/waldo#262 · Abierto el 4/2/2026
Paging samples does not preserve search GET parameters Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#261 · Abierto el 2/2/2026
No Well ID Preventing Editing Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#259 · 3 comentarios · Abierto el 21/1/2026
Relationships in annotation Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#258 · Abierto el 4/1/2026
Tracking of Samples Sent Out of Lab or Used Up Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

DReichLab/waldo#252 · 1 comentario · Abierto el 8/12/2025
Powder Batches Are Missing In WALDO Abierto

Urgent

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

DReichLab/waldo#250 · 2 comentarios · Abierto el 3/12/2025
Unique FluidX barcodes across lysates and libraries Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#249 · Abierto el 2/12/2025
questions about qpDstat Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

DReichLab/AdmixTools#123 · 2 comentarios · Abierto el 18/11/2025
Question about extremely high Z-scores (Z = 100) in qpDstat results Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

DReichLab/AdmixTools#122 · 2 comentarios · Abierto el 5/11/2025
Question about “duplicate in list” error and memory usage when running qpDstat Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

DReichLab/AdmixTools#121 · 1 comentario · Abierto el 4/11/2025
Anno file reports multiple samples Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#245 · Abierto el 30/10/2025
individual table Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#242 · Abierto el 27/10/2025
multiple collaborators per sample Abierto

waiting

DReichLab/waldo#238 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 6/10/2025
Question Regarding SNP Count After Merging Genotype Files Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

DReichLab/EIG#114 · 1 comentario · Abierto el 29/9/2025
catch newlines in validation Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#233 · Abierto el 26/9/2025
DS no barcode only index alert Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#232 · Abierto el 8/9/2025
Results with wrong plate pointers Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 38/100

DReichLab/waldo#231 · Abierto el 14/8/2025
F2 utility in admixtools? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

DReichLab/AdmixTools#117 · 3 comentarios · Abierto el 26/7/2025
external extracts/libraries material accounting Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#227 · Abierto el 10/7/2025
individual ID, sample pointers Abierto

DReichLab/waldo#225 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 26/6/2025
links from sample dates to periods, cultures, etc. Abierto

archaeology

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

DReichLab/waldo#222 · Abierto el 26/6/2025
Undefined behavior in PACKEDANCESTRYMAP hash code Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

DReichLab/EIG#113 · 1 comentario · Abierto el 19/6/2025
non-human samples Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 38/100

DReichLab/waldo#218 · Abierto el 12/6/2025
Renaming batches Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

DReichLab/waldo#210 · Abierto el 22/4/2025
Library batch add extracts Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 42/100

DReichLab/waldo#209 · Abierto el 22/4/2025
How is estimated the genetic distance Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

DReichLab/EIG#112 · Abierto el 22/4/2025

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