independent-filtering-variance: tier two Materials conditions and retire the validation step
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評価
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 初心者へのやさしさ
- 64/100
- issue の種類
- ドキュメント
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 活発
調査の方向性
Read the protocol’s Materials section, Step 1, and the review note at L96, then compare them with ADR 0017 and the parent issue #54. Revise Materials to include the specified input conditions, settle whether matrix orientation belongs in the protocol, and remove Step 1’s restatement; keep the procedure constraint and computation-time missingness check. Done when Materials and the remaining steps follow the ADR without duplicated conditions.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Part of #54. Validates today; this is the ADR 0017 revision.
Materials uses must four times (L35 twice, L37, L38), and this protocol is close to conforming. The gaps:
Untiered in Materials
- L34 "A feature-by-sample measurement matrix with one row per feature and one column per sample." must; Step 1 L43 verifies it. The review note at L96 questions whether orientation belongs in the protocol at all, which is worth settling in the same revision.
- L37 "
filter: eithervarianceormean. Select exactly one." must.
Only in Step 1, missing from Materials
- L43 adds "quality control" to the list of upstream steps that must be complete; Materials L35 names normalization and transformation only.
- L58 (Step 2) refers to "the study's missing-data policy", an input Materials does not list. The per-feature missingness check itself is computation-time and stays.
Not conditions on inputs
- L45 "Do not use sample labels, group assignments, outcomes, or preliminary test statistics to determine which features pass the filter" is a constraint on the procedure and stays.
Step 1 then restates Materials and can go, per the ADR.
🤖 Drafted with Claude Code
- 主要言語
- 言語のデータがありません
- スター
- 0
- フォーク
- 1
- 平均マージ
- 1日 9時間
- マージ済み PR（30日）
- 4
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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