Avoid R’s 2 GB string limit in read_cmdstan_csv()
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評価
調査の方向性
read_cmdstan_csv()、特にエラーで示されている data.table::fread(cmd=...) の呼び出しから始め、out-of-sample predictions を含む generated quantities で失敗を再現してください。sampler diagnostics がどのように読み取られるかを追跡し、R の string limit を超える出力に対して必要な、サポート対象の処理または workaround を特定してください。報告されたケースで失敗しなくなるか、文書化された workaround があれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
I am running a model with some out of sample predictions in generated quantities.
When I sample from the model without the out of sample predictions, everything is fine and runs as expected.
When I include the predictions, I get the following error:
Error in data.table::fread(cmd = fread_cmd, select = sampler_diagnostics, :
R character strings are limited to 2^31-1 bytes
Am I correct that this suggests a very long string is being generated somewhere? Is it possible to work around?
- 主要言語
- R
- スター
- 164
- フォーク
- 69
- 平均マージ
- 1日 10時間
- マージ済み PR（30日）
- 47
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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