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• fix: upgrade Sphinx to 7.x to restore Python 3.13+ docs build

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 82/100

  spacetx/starfish#2282 · 2026年11月12日 に作成

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• fix: repair broken AWS S3 links and add missing data links in osmFISH and ISS breast data-formatting examples

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

  spacetx/starfish#2216 · 担当者 1 名 · 2026年4月13日 に作成

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• In some downloadable scripts from ReadTheDocs executable code is labeled as markdown and requires excessive manual edits

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  spacetx/starfish#2161 · 2025年11月24日 に作成

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• seqFISH pipeline doesn't appear on ReadTheDocs pipeline examples

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

  spacetx/starfish#2153 · 2025年11月5日 に作成

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• barcodeBuildFunc modifies external variables

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  spacetx/starfish#2007 · コメント 1 件 · 2023年11月16日 に作成

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• Possible parameter inversion in LearnTransform.Translation class

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 40/100

  spacetx/starfish#2005 · コメント 2 件 · 2023年11月15日 に作成

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• "ValueError: in1 and in2 should have the same dimensionality" when "is_volume=True" for Filter.DeconvolvePSF

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

  spacetx/starfish#1912 · 2020年11月4日 に作成

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• IlastikPretrainedProbability is not compatible with cropped ImageStack

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  spacetx/starfish#1867 · 2020年4月10日 に作成

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• ApplyTransform.Warp.run() alters the TransformsList such that it can't be used again

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

  spacetx/starfish#1866 · コメント 1 件 · リアクション 2 件 · 2020年4月10日 に作成

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• get sphinx-gallery to render all examples

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

  spacetx/starfish#1865 · 2020年4月10日 に作成

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• hide code blocks in examples

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  spacetx/starfish#1864 · 2020年4月10日 に作成

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• suppress progress bar output in doc examples

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 45/100

  spacetx/starfish#1863 · 2020年4月10日 に作成

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• add traffic analytics to docs

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 15/100

  spacetx/starfish#1862 · 2020年4月10日 に作成

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• make sure readthedocs ad banner doesn't block content

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 55/100

  spacetx/starfish#1861 · 2020年4月10日 に作成

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• suppress all warnings in docs

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  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1860 · 2020年4月10日 に作成

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• add an ‘advanced analysis’ section with musings about things one might do

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  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 18/100

  spacetx/starfish#1858 · 2020年4月10日 に作成

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• Correcting Images How to: deconvolution

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 22/100

  spacetx/starfish#1857 · 2020年4月10日 に作成

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• Correcting Images How to: chromatic aberration

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 20/100

  spacetx/starfish#1856 · 2020年4月10日 に作成

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• update Output Formats

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

  spacetx/starfish#1855 · 2020年4月10日 に作成

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• update "installation"

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 20/100

  spacetx/starfish#1850 · 2020年4月10日 に作成

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• local_max_peak_finder throws error when `is_volume=False`

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  spacetx/starfish#1836 · 2020年3月24日 に作成

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• local_max_peak_finder reports too many spots when pixels have identical max intensity

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 30/100

  spacetx/starfish#1826 · コメント 4 件 · 2020年3月12日 に作成

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• local_max_peak_finder reports erroneous x/y/z data with cropped datasets

  再び着手できるかも @shanaxel42 が 2453 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  spacetx/starfish#1814 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2020年2月12日 に作成

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• support for 2D spot detection with TrackPy

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1813 · コメント 3 件 · 2020年2月12日 に作成

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• Improve CodebookValidator to check for likely errors

  再び着手できるかも @ttung が 2453 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  feature

  spacetx/starfish#1807 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2020年2月10日 に作成

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• parameterize trackpy_local_max_peak_finder?

  再び着手できるかも @mattcai が 2467 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  spacetx/starfish#1801 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2020年2月10日 に作成

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• [todo] optimize performance of ThresholdBinarize

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  spacetx/starfish#1789 · 2020年2月5日 に作成

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• [todo] improve ImageStack.shape type annotation

  再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1787 · コメント 3 件 · 2020年2月5日 に作成

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• [todo] explore quality score further

  再び着手できるかも @dganguli が 2472 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  spacetx/starfish#1784 · 担当者 1 名 · 2020年2月5日 に作成

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• [todo] add guardrails to display

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1782 · 2020年2月5日 に作成

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• add test for geojson

  再び着手できるかも @shanaxel42 が 2467 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  spacetx/starfish#1776 · 担当者 1 名 · 2020年2月5日 に作成

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• improve tests for normalize_code_traces

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  spacetx/starfish#1770 · 2020年2月5日 に作成

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• [todo] improve tests for calclulate_mean_pixel_traces

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1768 · 2020年2月5日 に作成

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• Quality Assessment Tutorials

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1752 · 2020年1月22日 に作成

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• Cell Assignment Tutorials

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1751 · 2020年1月22日 に作成

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• Signal Enhancement Tutorials

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

  spacetx/starfish#1747 · 2020年1月22日 に作成

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• Image Corrections Tutorials

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  spacetx/starfish#1746 · 2020年1月22日 に作成

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• Add a bare minimum "Getting started" page

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  spacetx/starfish#1744 · 2020年1月22日 に作成

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• Reorganize content in documentation

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  spacetx/starfish#1742 · 2020年1月22日 に作成

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• Use 3D border exclusion for ISS

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  spacetx/starfish#1732 · コメント 1 件 · 2020年1月13日 に作成

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• Add view method for SpotFindingResults

  再び着手できるかも @shanaxel42 が 2501 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  spacetx/starfish#1721 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2020年1月7日 に作成

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• API is documentated with links to examples

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  spacetx/starfish#1716 · 2020年1月6日 に作成

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• add 3D support to LocalMaxPeakFinder

  再び着手できるかも @shanaxel42 が 2543 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  spacetx/starfish#1679 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2019年11月26日 に作成

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• use intersphinx to provide inline links to other package's documentation

  再び着手できるかも @mattcai が 2430 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  spacetx/starfish#1678 · 担当者 1 名 · 2019年11月26日 に作成

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• Improve access to datasets

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  spacetx/starfish#1677 · 2019年11月25日 に作成

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• Support for segmentation-free cell assignment

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  feature help wanted

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

  spacetx/starfish#1675 · リアクション 1 件 · 2019年11月25日 に作成

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• adding support for proteomics assays

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  feature help wanted

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

  spacetx/starfish#1674 · 2019年11月25日 に作成

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• display() compatibility with SpotFindingResults or descriptive error

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

  spacetx/starfish#1661 · 2019年11月20日 に作成

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• 3D image registration

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  spacetx/starfish#1620 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 · 2019年10月18日 に作成

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• Document data availability

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  難易度 2/5 半日 初心者へのやさしさ 48/100

  spacetx/starfish#1612 · コメント 2 件 · 2019年10月14日 に作成

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