Add a fill-in params file and fix the example samplesheet
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 初心者へのやさしさ
- 66/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 活発
- 技術スタック
- yaml
調査の方向性
Start with the README parameter definitions and inspect assets/samplesheet.csv alongside the pipeline’s startup validation for sample layout. Add assets/params_example.yaml with the four required parameters and optional defaults commented out, correct the single-end second row, and document whether params-file overrides replace the full sam2sites_params and sites2genes_params maps. Done when the example inputs are accepted and the map behavior is documented.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Part of #5.
A new user has to assemble the inputs from the README. Add:
assets/params_example.yamlwith the four required parameters and the optional ones commented out at their defaults- a fix for
assets/samplesheet.csv: its second row is a single-end sample, which the pipeline rejects at startup
Check that overriding a map parameter (sam2sites_params, sites2genes_params) from a params file replaces the whole map, and document it.
- 主要言語
- Nextflow
- スター
- 0
- フォーク
- 1
- 平均マージ
- 10時間 36分
- マージ済み PR（30日）
- 4
環境構築
このプロジェクトの開発コンテナを、あなたの GitHub アカウントでブラウザ上に起動します。
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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