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Sam_to_bam - make reference genome selection optional

オープン
#174 コメント 1 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

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評価

難易度
2/5
見積もり時間
1〜3時間
初心者へのやさしさ
45/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
停滞

調査の方向性

まず Sam_to_bam ツールの定義を見つけ、現在リファレンスゲノムの選択がどのように必須になっているかを確認します。ヘッダー付きの SAM ファイルでの動作を確認し、その後、既存の変換動作を維持したままリファレンスの選択を省略できることを検証します。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

Most SAM files will have the header and so samtools does not need the reference, therefor the reference genome selection could or should be optional.

主要言語
Python
スター
37
フォーク
94
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

環境構築

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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