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Sam_to_bam - make reference genome selection optional

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#174 1 commento 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

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Valutazione

Difficoltà
2/5
Tempo stimato
1-3 ore
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Ambito
bioinformatics

Direzione di ricerca

Inizia individuando la definizione dello strumento Sam_to_bam e verificando come sia attualmente richiesta la selezione del genoma di riferimento. Controlla il comportamento per i file SAM con intestazioni, quindi verifica che la selezione del riferimento possa essere omessa mantenendo invariato il comportamento di conversione esistente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Most SAM files will have the header and so samtools does not need the reference, therefor the reference genome selection could or should be optional.

Lingua principale
Python
Stelle
37
Fork
94
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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