overwrite-different flag issue
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まだ誰も着手していません。
評価
調査の方向性
報告されたターミナル出力を使って dandi download -e overwrite-different を再現することから始め、スキップされたファイルとダウンロード率を確認します。スキップまたはダウンロードされたファイルに関する進捗表示と、断続的に発生する Persisting input arguments 警告を調査します。報告されたエラーなしに、ダウンロード率がファイルの状態を正確に反映すれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
when running dandi download with -e overwrite-different the below error intermittently pops up and the download percentages remain at zero even if it does reflect files are being skipped or downloaded.
Error:
UserWarning: Persisting input arguments took 1.78s to run.If this happens often in your code, it can cause performance problems (results will be correct in all cases). The reason for this is probably some large input arguments for a wrapped function.
copy of terminal output where percentages are 0% although files have been skipped
PATH SIZE DONE DONE% CHECKSUM STATUS MESSAGE
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS38_stain-Somatostatin_SPIM.ome.zarr 0 Bytes 0% 2044 skipped
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS38_stain-NeuN_SPIM.ome.zarr 0 Bytes 0% 2051 skipped
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS35_stain-NeuN_SPIM.ome.zarr 0 Bytes 0% 2047 skipped
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS35_stain-Somatostatin_SPIM.ome.zarr 0 Bytes 0% 2039 skipped
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS35_stain-Calretinin_SPIM.ome.zarr 0 Bytes 0% 2038 skipped
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS41_stain-Calretinin_SPIM.ome.zarr 0 Bytes 0% 2049 skipped
- 主要言語
- Python
- スター
- 28
- フォーク
- 37
- 平均マージ
- 1日 17時間
- マージ済み PR（30日）
- 11
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
dandi/dandi-cli のほかの issue
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pynwb metadata: get neurodata types再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100
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-
`metadata.nwb.get_metadata()` validates the whole BIDS dataset for every NWB file, then discards the result対応中かも @CodyCBakerPhD が 15 日前に担当しました。 オープンBIDS performance
dandi/dandi-cli#1962 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 ·
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BIDS bug
難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 45/100
dandi/dandi-cli#1961 · コメント 4 件 ·
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dandi/dandi-cli#1920 · コメント 2 件 ·
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