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overwrite-different flag issue

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I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
cli

Direzione di ricerca

Inizia riproducendo dandi download -e overwrite-different usando l’output del terminal riportato, osservando i file saltati e le percentuali di download. Analizza la visualizzazione dell’avanzamento relativa ai file saltati o scaricati e l’avviso intermittente Persisting input arguments; il lavoro è completato quando le percentuali riflettono accuratamente lo stato dei file senza l’errore segnalato.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

when running dandi download with -e overwrite-different the below error intermittently pops up and the download percentages remain at zero even if it does reflect files are being skipped or downloaded.

Error:

UserWarning: Persisting input arguments took 1.78s to run.If this happens often in your code, it can cause performance problems (results will be correct in all cases). The reason for this is probably some large input arguments for a wrapped function.

copy of terminal output where percentages are 0% although files have been skipped

PATH                                                                                        SIZE     DONE    DONE% CHECKSUM STATUS MESSAGE       
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS38_stain-Somatostatin_SPIM.ome.zarr          0 Bytes    0%                 2044 skipped  
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS38_stain-NeuN_SPIM.ome.zarr                  0 Bytes    0%                 2051 skipped  
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS35_stain-NeuN_SPIM.ome.zarr                  0 Bytes    0%                 2047 skipped  
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS35_stain-Somatostatin_SPIM.ome.zarr          0 Bytes    0%                 2039 skipped  
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS35_stain-Calretinin_SPIM.ome.zarr            0 Bytes    0%                 2038 skipped  
sub-I45/ses-SPIM/micr/sub-I45_ses-SPIM_sample-BrocaAreaS41_stain-Calretinin_SPIM.ome.zarr            0 Bytes    0%                 2049 skipped
Lingua principale
Python
Stelle
29
Fork
37
Merge medio
1g 5h
PR unite (30g)
20

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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