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campaslab

索引済みのリポジトリ 3 件 · GitHub で見る

napari-stress
Interactive surface analysis in napari for bio-mechanical stress measurement

Python · スター 18 個
STRESS

Python · スター 8 個
Osmotic-Pressure-droplet-volume-reading
Code assocaiated to the article In situ quantification of osmotic pressure within living embryonic tissues

MATLAB · スター 0 個

初心者向けすべて

オープンすべて

Possible argument-order bug in sph_harm → sph_harm_y migration オープン

bug

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 74/100

campaslab/napari-stress#426 · リアクション 1 件 · 2026年7月24日に作成
Point cloud vtp file output only in "interactive usage" but not in "from code" オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#424 · 2026年1月16日に作成
Physical units in final output オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 38/100

campaslab/napari-stress#423 · 2025年7月29日に作成
Stratify tests オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#405 · 2025年4月30日に作成
output figure: Stresses_cell オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#401 · コメント 1 件 · 2025年4月1日に作成
screentshot of napari stress オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

campaslab/napari-stress#399 · 2025年3月24日に作成
Empty values in tissue stress autocorrelation オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

campaslab/napari-stress#397 · 2025年3月24日に作成
Use `napari-timelapse-processor` instead of internal `frame_by_frame` オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#382 · 2024年8月8日に作成
Glossary add-on オープン

documentation

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#379 · コメント 1 件 · 2024年7月17日に作成
Clarify documentation オープン

documentation

難易度 1/5 1時間未満初心者へのやさしさ 45/100

campaslab/napari-stress#377 · 2024年7月17日に作成
No data plotted :( オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

campaslab/napari-stress#360 · コメント 2 件 · 2024年4月5日に作成
Correct Voxel Size in Sample Data オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/STRESS#4 · 2024年1月15日に作成
Rename Output Image Files from Droplet Reconstruction Tool box オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

campaslab/STRESS#3 · 2024年1月15日に作成
Measuring intensities on rescaled images オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#352 · コメント 1 件 · 2024年1月4日に作成
Add license and Readme.md オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/Osmotic-Pressure-droplet-volume-reading#1 · コメント 1 件 · 2023年8月29日に作成
Feedback on reconstruction quality confocal vs spinning disc imaging オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 18/100

campaslab/napari-stress#317 · コメント 9 件 · 2023年7月24日に作成
Remove numpy pin オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

campaslab/napari-stress#303 · 2023年6月27日に作成
Quantify tissue-scale stresses along AP, ML and DV axis of Zebrafish embryo? オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 15/100

campaslab/napari-stress#300 · コメント 1 件 · 2023年6月16日に作成
Fix bug with surface subsampling オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 30/100

campaslab/napari-stress#298 · 2023年6月16日に作成
Smoothing default value to higher value? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#296 · 2023年6月16日に作成
Improve outlier removal オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 30/100

campaslab/napari-stress#295 · 2023年6月16日に作成
Parameters in droplet reconstruction in microns オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

campaslab/napari-stress#294 · コメント 1 件 · 2023年6月16日に作成
Improve docstrings for spherical harmonics オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#291 · 2023年6月7日に作成
Add reference coordinate for stress projections オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

campaslab/napari-stress#290 · 2023年6月7日に作成
Measure mean squared displacement オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#289 · 2023年6月7日に作成
Add measurement selection to comprehensive measurement toolbox オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

campaslab/napari-stress#281 · 2023年5月9日に作成
Add `frame` column to features dataframes オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

campaslab/napari-stress#276 · 2023年3月16日に作成
Add info on how to use toolboxes オープン

documentation

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 50/100

campaslab/napari-stress#257 · 2023年3月1日に作成
Interactive mean curvature measurement not working オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 42/100

campaslab/napari-stress#233 · 2023年1月26日に作成
Visualizing `mean_curvature` on lebedev quadrature throws error オープン

bug

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 55/100

campaslab/napari-stress#232 · コメント 1 件 · 2023年1月26日に作成
Consider moving measurements to other Tools menu オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#225 · コメント 1 件 · 2023年1月22日に作成
Open file dialogue in analyze_everything notebook to select file オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#216 · 2022年11月18日に作成
Documentation pointing to `Plugins` menu オープン

documentation

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#208 · 2022年11月11日に作成
Add more description to `Analyze_everything.ipynb` オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 55/100

campaslab/napari-stress#204 · 2022年11月8日に作成
Remove binarization and labeling from droplet reconstruction toolbox オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#186 · 2022年10月26日に作成
napari_stl_exporter not found オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 38/100

campaslab/napari-stress#175 · 2022年10月21日に作成
`Mean curvature on manifold` throws error if `ImageData` in layer list オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#164 · 2022年9月26日に作成
Trace-Refine Surface Points Error オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#160 · コメント 2 件 · 2022年9月22日に作成
'mean_curvature_on_manifold' feature not showing オープン

enhancement

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#149 · コメント 1 件 · 2022年9月7日に作成
Add `frame_by_frame` to `perform_lebedev_quadrature` オープン

bug core functionality

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

campaslab/napari-stress#148 · 2022年8月30日に作成
Add measurement for vector length オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#126 · 2022年8月8日に作成
Move timelapse converter upstream オープン

help wanted nice to have

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#104 · 2022年7月28日に作成
Improve code quality オープン

nice to have

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 42/100

campaslab/napari-stress#96 · 2022年7月9日に作成
Spherical harmonics coefficients formatting オープン

enhancement nice to have

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

campaslab/napari-stress#86 · コメント 16 件 · 2022年6月17日に作成
Empty output directories オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/STRESS#1 · コメント 1 件 · 2022年6月14日に作成
Make napari-stress available on conda-forge オープン

nice to have

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#76 · 2022年6月5日に作成
Dependency conflict with morphometrics オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 38/100

campaslab/napari-stress#73 · コメント 5 件 · 2022年6月5日に作成
Trace refinement from tools menu オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

campaslab/napari-stress#68 · コメント 8 件 · 2022年6月3日に作成
napari-stress ships napari==0.4.14 オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

campaslab/napari-stress#62 · コメント 4 件 · 2022年6月3日に作成
Check if it actually is 4D オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

campaslab/napari-stress#13 · コメント 3 件 · 2022年4月23日に作成

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