Multiple Death Records Due to Death_type or Cause - Version 5.4
@RogerJCarlson がすでに取り組んでいます。
2023年9月6日 から。
評価
この issue はまだ評価されていません。
説明
Issue Name: Multiple Death Records Due to Death_type_concept or Cause_concept Version 5.4
Issue Type: Duplicate records caused by multiple standard concept_ids for death cause or death type (provenance)
Description: http://ohdsi.github.io/CommonDataModel/cdm54.html#DEATH
The table description for the Death table has the following: "A person can have up to one record if the source system contains evidence about the Death". However, an ICD diagnosis code may map to multiple SNOMED codes:
ICD10: J96.21 (Acute on chronic respiratory failure with hypoxia (HCC))
maps to
SNOMED: 389086002 (Hypoxia) and 67905004 (Acute-on-chronic respiratory failure)
This results in two records with the same death date.
Similarly, a person may have death records from multiple systems (provenance), i.e. EHR and death registry.
Suggested Solution: For OMOP version 5.4, allow multiple records in the Death table caused by either the death_type_concept_id and/or cause_concept_id. However the Death_Date(s) must match.
Possible Implications:
- CDM documentation will need to be modified.
- The rules of the DQD (Data Quality Dashboard) will have to be adjusted to match.
- Others?
Related forum post: https://forums.ohdsi.org/t/multiple-death-records-due-to-snomed-mapping/19517
Reported By: Roger Carlson
- 主要言語
- HTML
- スター
- 1.1k
- フォーク
- 513
- 平均マージ
- 8日 3時間
- マージ済み PR（30日）
- 4
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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