Multiple Death Records Due to Death_type or Cause - Version 5.4
@RogerJCarlson ya está trabajando en esto.
Desde el 6/9/2023.
Evaluación
Este issue todavía no se ha evaluado.
Descripción
Issue Name: Multiple Death Records Due to Death_type_concept or Cause_concept Version 5.4
Issue Type: Duplicate records caused by multiple standard concept_ids for death cause or death type (provenance)
Description: http://ohdsi.github.io/CommonDataModel/cdm54.html#DEATH
The table description for the Death table has the following: "A person can have up to one record if the source system contains evidence about the Death". However, an ICD diagnosis code may map to multiple SNOMED codes:
ICD10: J96.21 (Acute on chronic respiratory failure with hypoxia (HCC))
maps to
SNOMED: 389086002 (Hypoxia) and 67905004 (Acute-on-chronic respiratory failure)
This results in two records with the same death date.
Similarly, a person may have death records from multiple systems (provenance), i.e. EHR and death registry.
Suggested Solution: For OMOP version 5.4, allow multiple records in the Death table caused by either the death_type_concept_id and/or cause_concept_id. However the Death_Date(s) must match.
Possible Implications:
- CDM documentation will need to be modified.
- The rules of the DQD (Data Quality Dashboard) will have to be adjusted to match.
- Others?
Related forum post: https://forums.ohdsi.org/t/multiple-death-records-due-to-snomed-mapping/19517
Reported By: Roger Carlson
- Lenguaje dominante
- HTML
- Estrellas
- 1.1k
- Forks
- 515
- Merge medio
- 8 d 3 h
- PR fusionados (30 d)
- 4
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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