GROMACS results: what a minimisation shows (pressure, step plots, energy format)
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 活発
- 技術スタック
- c
調査の方向性
Start in the Builder's Properties results view for a finished GROMACS minimisation, where pressure is shown as a full-height scalar panel, and in the Geometry Step Plots menu, which offers only Pressure and greys out the Y-axis. Done means that pressure is hidden for EM, potential energy and Fmax are selectable against step, step-click is active only when frames exist, and energies use significant figures with kJ/mol. Design choices are still open, so confirm them with maintainers (#180, #262, #241) before coding.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Found 2026-10-15 viewing a finished GROMACS minimisation (MINFF clay, 10236 atoms) in the Builder's Properties.
- Pressure is shown for a minimisation as a single final value (2030.8600000000 Bar) in a full-height panel. Pressure during an energy minimisation has no physical meaning: there are no velocities, so no kinetic term. Drop it for EM. For MD, show pressure as a time series beside temperature and density, not as a scalar.
- Geometry Step Plots offers only Pressure vs step, and the Y-axis menu is greyed out. For EM the useful series are potential energy and maximum force (Fmax) against step, the convergence quantities.
- Clicking a point should show that step's structure only when frames exist. EM normally writes only the final structure, so without frames the plot should not look clickable.
- Animation belongs to MD trajectories (#180), with the plot cursor following the frame.
- Total energy is shown as -4514170.000000 kJoule/Mole: fixed decimals on a large value, and the unit is spelled kJoule/Mole. Use significant figures and kJ/mol.
- A scalar property should not take a full-height panel.
For the GROMACS round (#262/#241). Related: #180.
- 主要言語
- C
- スター
- 10
- フォーク
- 8
- 平均マージ
- 21分
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
FriendsofECCE/ECCE のほかの issue
-
難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 70/100
FriendsofECCE/ECCE#353 ·
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100
FriendsofECCE/ECCE#336 · コメント 1 件 ·
-
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100
FriendsofECCE/ECCE#355 ·
-
Icons in MacOSオープンenhancement
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 18/100
FriendsofECCE/ECCE#354 · コメント 4 件 ·
-
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100
FriendsofECCE/ECCE#351 ·
FriendsofECCE/ECCE の issue をすべて見る
似ている issue
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 66/100
FujiNetWIFI/fujinet-lib#186 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100
PackageKit/PackageKit#1027 ·