Seven attributes have under 35 annotations; merge or leave out of the release
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Idoneità per principianti
- 22/100
Direzione di ricerca
The payload names no files, tests or entry points, only the attribute names and their annotation counts. Start by finding where those attributes are defined in the annotation sheets, and confirm the counts. The issue asks the maintainer to choose between merging the producing traits into one metabolic product attribute and holding back the under-100 attributes from the release, so a newcomer should not start until that decision is made.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Ten of the 32 attributes have fewer than 100 source annotations, six fewer than 30: health associated (29), butyrate-producing bacteria (28), mutation rate per site per year (33), mutation rate per site per generation (26), sphingolipid producing (20), lactate producing (15), hydrogen gas producing (14). None of them can be propagated by ASR or make a signature of the default minSize = 10 at most ranks. Counting them as attributes in the paper ("32 attributes") overstates the resource.
Options, pick one:
- Fold the "producing" traits into a single multistate-union attribute
metabolic product(acetate, butyrate, lactate, hydrogen gas, sphingolipid) and add sources: Madin 2020 and BacDive both have fermentation products, and #144 asked for this in 2022. - Keep them in the sheets but leave them out of the release and the manuscript count until each has, say, 100 annotations.
I'd do both: merge, then apply the floor.
Drafted with Claude Code.
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 6
- Fork
- 6
- Merge medio
- 1h 48m
- PR unite (30g)
- 13
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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