scverse/pertpy

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Single-cell perturbation analysis

Stelle: 346
Fork: 67
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 11
Merge medio: 1g 7h
PR unite (30g): 13

Lingua principale: Python
Licenza: MIT
Ultimo push su GitHub: 18/9/2026
Ultima indicizzazione: 19/9/2026
Guida per i contributori: Guida per i contributori
Codice di condotta: Codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Integration Testing CI Test Failure on python 3.12 Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

scverse/pertpy#1108 · Aperta il 23/9/2026
Remove anndata pin when 0.14.0 is released Aperta

scverse/pertpy#1071 · 1 assegnatario · Aperta il 7/8/2026
Multimodal perturbation readouts (Perturb-CITE-seq, Perturb-ATAC, multiome) Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

scverse/pertpy#1039 · Aperta il 7/7/2026
Spatial perturbation analysis Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

scverse/pertpy#1038 · Aperta il 7/7/2026
Experimental design & power analysis for perturbation screens Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

scverse/pertpy#1037 · Aperta il 7/7/2026
Drug-discovery analyses: connectivity-map / signature reversal, synergy & dose-response, genetic interactions Aperta

enhancement

scverse/pertpy#1036 · 10 commenti · 2 assegnatari · Aperta il 7/7/2026
Benchmarking & evaluation harness for perturbation prediction (baseline-aware) Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

scverse/pertpy#1035 · Aperta il 7/7/2026
Response prediction: predict unseen perturbations & combinations (GEARS, CPA/chemCPA, biolord, FM embeddings) Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

scverse/pertpy#1034 · Aperta il 7/7/2026
Move differential expression analysis to separate package Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

scverse/pertpy#730 · 5 commenti · 4 reazioni · Aperta il 19/3/2025
Add linear mixed effects model to DE interface Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

scverse/pertpy#614 · 1 reazione · Aperta il 27/5/2024

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