scverse/pertpy

Ver en GitHub

Single-cell perturbation analysis

Estrellas: 346
Forks: 67
Issues abiertos para principiantes: 0
Issues indexados: 10
Merge medio: 1 d 5 h
PR fusionados (30 d): 14

Lenguaje dominante: Python
Licencia: MIT
Último push a GitHub: 18/9/2026
Última indexación: 19/9/2026
Guía de contribución: Guía de contribución
Código de conducta: Código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

9 issues abiertos indexados

Remove anndata pin when 0.14.0 is released Abierto

scverse/pertpy#1071 · 1 asignado · Abierto el 7/8/2026
Multimodal perturbation readouts (Perturb-CITE-seq, Perturb-ATAC, multiome) Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

scverse/pertpy#1039 · Abierto el 7/7/2026
Spatial perturbation analysis Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

scverse/pertpy#1038 · Abierto el 7/7/2026
Experimental design & power analysis for perturbation screens Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

scverse/pertpy#1037 · Abierto el 7/7/2026
Drug-discovery analyses: connectivity-map / signature reversal, synergy & dose-response, genetic interactions Abierto

enhancement

scverse/pertpy#1036 · 10 comentarios · 2 asignados · Abierto el 7/7/2026
Benchmarking & evaluation harness for perturbation prediction (baseline-aware) Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

scverse/pertpy#1035 · Abierto el 7/7/2026
Response prediction: predict unseen perturbations & combinations (GEARS, CPA/chemCPA, biolord, FM embeddings) Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

scverse/pertpy#1034 · Abierto el 7/7/2026
Move differential expression analysis to separate package Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

scverse/pertpy#730 · 5 comentarios · 4 reacciones · Abierto el 19/3/2025
Add linear mixed effects model to DE interface Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

scverse/pertpy#614 · 1 reacción · Abierto el 27/5/2024

scverse/pertpy

Recibe los nuevos issues en tu correo