Issue di nextflow-io/nextflow

Star: (3382 star)
Fork: (784 fork)
Issue indicizzate: (34 issue indicizzate)
issue per principianti aperte: (34 issue per principianti aperte)
Ultima indicizzazione: 9 giu 2026
Ultimo push GitHub: 15 mag 2026
Licenza: Apache License 2.0
Guida contributori: Guida contributori
Codice di condotta: Codice di condotta
Linguaggio principale: Groovy
Metriche merge PR: (Merge medio 3g 18h) (38 PR mergiate in 30 g)
Label per principianti: good first issuehelp wanted

Issue

34 issue indicizzate aperte

RSS Atom

Aperta

Expand `.splitCsv()` to allow comments in CSV and TSV files

good first issue

nextflow-io/nextflow #6705 aperta 8 gen 2026 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

6 commenti1 reazione0 assegnatari

Aperta

Adding a parameter for AnsiLogObserver delay

good first issue

nextflow-io/nextflow #6518 aperta 28 ott 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

1 commento0 reazioni0 assegnatari

Aperta

Support shallow clones of submodules

good first issuesoftware/gitstale

nextflow-io/nextflow #6301 aperta 22 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

0 commenti3 reazioni0 assegnatari

Aperta

Cumulative job duration (realtime) in the nextflow execution report

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #6298 aperta 22 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

0 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

COLUMNS environment variable not honored

good first issue

nextflow-io/nextflow #6274 aperta 14 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

0 commenti2 reazioni0 assegnatari

Aperta

Add an env var which points to a config file for all pipelines

good first issuelang/config

nextflow-io/nextflow #6151 aperta 3 giu 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

4 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

Support for Pixi

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #6092 aperta 16 mag 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

3 commenti17 reazioni0 assegnatari

Aperta

AWS Batch Fargate requires exact CPU values?

executor/aws-batchgood first issue

nextflow-io/nextflow #5781 aperta 12 feb 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

4 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

How to set the computing resources (cpus, memory) in total submitted jobs

executor/slurmgood first issuestale

nextflow-io/nextflow #5702 aperta 23 gen 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

6 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

A flag to remove quotation marks from index file

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #5546 aperta 27 nov 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

1 commento0 reazioni0 assegnatari

Aperta

moduleBinaries doesn't work with top-level module

buggood first issuelang/modules

nextflow-io/nextflow #5288 aperta 5 set 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

3 commenti1 reazione0 assegnatari

Aperta

Nextflow on POSIX breaking on input paths starting with hyphen / dash ('-')

good first issuesoftware/bash

nextflow-io/nextflow #5186 aperta 31 lug 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

1 commento0 reazioni0 assegnatari

Aperta

Error when using Shifter as container runtime in Nextflow >23.08.0-edge

help wantedstale

nextflow-io/nextflow #5115 aperta 5 lug 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Guida alla contribuzione disponibile

Nessun assegnatarioGuida alla contribuzione disponibile

1 commento0 reazioni0 assegnatari

Aperta

"Missing project main script" error when there is a directory with the workflow name

error-improvementsgood first issue

nextflow-io/nextflow #5073 aperta 18 giu 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataContrassegnata come good first issue · Guida alla contribuzione disponibile

Contrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

3 commenti0 reazioni1 assegnatario

Aperta

splitCsv handles commas incorrectly when cells contain commas within quoted strings

good first issue

nextflow-io/nextflow #4874 aperta 2 apr 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

4 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

In Summary Report Task Table long process names overflow into adjacent cells

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #4752 aperta 16 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

2 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

In summary report, allow breakdowns by sub-workflow for processes

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #4751 aperta 16 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

2 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

Support container streaming for Google Batch

executor/google-batchgood first issue

nextflow-io/nextflow #4719 aperta 7 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

3 commenti0 reazioni0 assegnatari

Aperta

Add hyperlinks to HTML DAG

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #4346 aperta 26 set 2023 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

1 commento1 reazione0 assegnatari

Aperta

GPU usage metrics

good first issueplanned

nextflow-io/nextflow #4286 aperta 10 set 2023 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Star: (3382 star)
Fork: (784 fork)
Issue indicizzate: (34 issue indicizzate)
issue per principianti aperte: (34 issue per principianti aperte)
Ultima indicizzazione: 9 giu 2026
Ultimo push GitHub: 15 mag 2026
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Guida contributori: Guida contributori
Codice di condotta: Codice di condotta
Linguaggio principale: Groovy
Metriche merge PR: (Merge medio 3g 18h) (38 PR mergiate in 30 g)
Label per principianti: good first issuehelp wanted

Issue

34 issue indicizzate aperte

RSS Atom

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Expand `.splitCsv()` to allow comments in CSV and TSV files

good first issue

nextflow-io/nextflow #6705 aperta 8 gen 2026 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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Adding a parameter for AnsiLogObserver delay

good first issue

nextflow-io/nextflow #6518 aperta 28 ott 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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Support shallow clones of submodules

good first issuesoftware/gitstale

nextflow-io/nextflow #6301 aperta 22 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Cumulative job duration (realtime) in the nextflow execution report

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #6298 aperta 22 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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COLUMNS environment variable not honored

good first issue

nextflow-io/nextflow #6274 aperta 14 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Add an env var which points to a config file for all pipelines

good first issuelang/config

nextflow-io/nextflow #6151 aperta 3 giu 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Support for Pixi

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #6092 aperta 16 mag 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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AWS Batch Fargate requires exact CPU values?

executor/aws-batchgood first issue

nextflow-io/nextflow #5781 aperta 12 feb 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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How to set the computing resources (cpus, memory) in total submitted jobs

executor/slurmgood first issuestale

nextflow-io/nextflow #5702 aperta 23 gen 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

6 commenti0 reazioni0 assegnatari

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A flag to remove quotation marks from index file

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #5546 aperta 27 nov 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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moduleBinaries doesn't work with top-level module

buggood first issuelang/modules

nextflow-io/nextflow #5288 aperta 5 set 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

3 commenti1 reazione0 assegnatari

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Nextflow on POSIX breaking on input paths starting with hyphen / dash ('-')

good first issuesoftware/bash

nextflow-io/nextflow #5186 aperta 31 lug 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

1 commento0 reazioni0 assegnatari

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Error when using Shifter as container runtime in Nextflow >23.08.0-edge

help wantedstale

nextflow-io/nextflow #5115 aperta 5 lug 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Guida alla contribuzione disponibile

Nessun assegnatarioGuida alla contribuzione disponibile

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"Missing project main script" error when there is a directory with the workflow name

error-improvementsgood first issue

nextflow-io/nextflow #5073 aperta 18 giu 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataContrassegnata come good first issue · Guida alla contribuzione disponibile

Contrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

3 commenti0 reazioni1 assegnatario

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splitCsv handles commas incorrectly when cells contain commas within quoted strings

good first issue

nextflow-io/nextflow #4874 aperta 2 apr 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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In Summary Report Task Table long process names overflow into adjacent cells

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #4752 aperta 16 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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In summary report, allow breakdowns by sub-workflow for processes

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #4751 aperta 16 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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Support container streaming for Google Batch

executor/google-batchgood first issue

nextflow-io/nextflow #4719 aperta 7 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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good first issuestale

nextflow-io/nextflow #4346 aperta 26 set 2023 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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GPU usage metrics

good first issueplanned

nextflow-io/nextflow #4286 aperta 10 set 2023 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Star: (3382 star)
Fork: (784 fork)
Issue indicizzate: (34 issue indicizzate)
issue per principianti aperte: (34 issue per principianti aperte)
Ultima indicizzazione: 9 giu 2026
Ultimo push GitHub: 15 mag 2026
Licenza: Apache License 2.0
Guida contributori: Guida contributori
Codice di condotta: Codice di condotta
Linguaggio principale: Groovy
Metriche merge PR: (Merge medio 3g 18h) (38 PR mergiate in 30 g)
Label per principianti: good first issuehelp wanted

Issue

34 issue indicizzate aperte

RSS Atom

Aperta

Expand `.splitCsv()` to allow comments in CSV and TSV files

good first issue

nextflow-io/nextflow #6705 aperta 8 gen 2026 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

6 commenti1 reazione0 assegnatari

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Adding a parameter for AnsiLogObserver delay

good first issue

nextflow-io/nextflow #6518 aperta 28 ott 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Support shallow clones of submodules

good first issuesoftware/gitstale

nextflow-io/nextflow #6301 aperta 22 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Cumulative job duration (realtime) in the nextflow execution report

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #6298 aperta 22 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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COLUMNS environment variable not honored

good first issue

nextflow-io/nextflow #6274 aperta 14 lug 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Nessun commento

Nessun assegnatarioNessun commentoContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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Add an env var which points to a config file for all pipelines

good first issuelang/config

nextflow-io/nextflow #6151 aperta 3 giu 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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nextflow-io/nextflow #6092 aperta 16 mag 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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AWS Batch Fargate requires exact CPU values?

executor/aws-batchgood first issue

nextflow-io/nextflow #5781 aperta 12 feb 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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How to set the computing resources (cpus, memory) in total submitted jobs

executor/slurmgood first issuestale

nextflow-io/nextflow #5702 aperta 23 gen 2025 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

Nessun assegnatarioContrassegnata come good first issueGuida alla contribuzione disponibile

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good first issuestale

nextflow-io/nextflow #5546 aperta 27 nov 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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moduleBinaries doesn't work with top-level module

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nextflow-io/nextflow #5288 aperta 5 set 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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Nextflow on POSIX breaking on input paths starting with hyphen / dash ('-')

good first issuesoftware/bash

nextflow-io/nextflow #5186 aperta 31 lug 2024 · Groovy · 3382 star

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Error when using Shifter as container runtime in Nextflow >23.08.0-edge

help wantedstale

nextflow-io/nextflow #5115 aperta 5 lug 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Guida alla contribuzione disponibile

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"Missing project main script" error when there is a directory with the workflow name

error-improvementsgood first issue

nextflow-io/nextflow #5073 aperta 18 giu 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataContrassegnata come good first issue · Guida alla contribuzione disponibile

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splitCsv handles commas incorrectly when cells contain commas within quoted strings

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nextflow-io/nextflow #4874 aperta 2 apr 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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In Summary Report Task Table long process names overflow into adjacent cells

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nextflow-io/nextflow #4752 aperta 16 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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In summary report, allow breakdowns by sub-workflow for processes

good first issuestale

nextflow-io/nextflow #4751 aperta 16 feb 2024 · Groovy · 3382 star

Perché consigliataNessun assegnatario · Contrassegnata come good first issue

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executor/google-batchgood first issue

nextflow-io/nextflow #4719 aperta 7 feb 2024 · Groovy · 3382 star

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nextflow-io/nextflow #4346 aperta 26 set 2023 · Groovy · 3382 star

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