Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

mskcc/beagle

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Voyager Backend

¿Es mskcc/beagle apto para principiantes?

Los mantenedores de mskcc/beagle suelen responder a un pull request en 1 día. Ahora mismo hay 1 issue apto para principiantes abierto.

Estrellas
2
Forks
7
Issues abiertos para principiantes
1
Issues indexados
99
Merge medio
2 d 21 min
PR fusionados (30 d)
6
Lenguaje dominante
Python
Licencia
Apache-2.0
Último push a GitHub
25/9/2026
Última indexación
19/9/2026
Sin guía de contribución
Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes
help wanted

Cómo contribuir a mskcc/beagle

  1. No hay guía de contribución, así que empieza por el README y por algunos pull requests fusionados hace poco para ver cómo se proponen los cambios.
  2. Incluye un Dockerfile o un archivo de Docker Compose, así que puedes ejecutarlo sin instalar todas sus herramientas.
  3. Tus contribuciones se publicarán bajo la licencia Apache-2.0 del proyecto.
  4. Elige el issue abierto apto para principiantes de abajo y comenta que quieres trabajar en él antes de empezar.
Para principiantes Todo
Abierto Todos

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

  • Remove all harded references to juno
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

    mskcc/beagle#1500 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • How will strict syntax affect repo
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    mskcc/beagle#1493 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update mock metadata
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    mskcc/beagle#1125 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Cannot logout of admin on swagger page
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#1122 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • tempo-mpgen column names inconsistent with schema
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    mskcc/beagle#1068 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Operator errors are hidden in the logs
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#1058 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Approved users does not populate the user model
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#1053 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Cannot log out as admin
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#1052 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Replace User Specific Paths on Jinja Template
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    mskcc/beagle#1034 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Github Repo page for Tempo
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#1030 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Need to updated paths
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    mskcc/beagle#1028 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • checking if historical pairing file was de-synced
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    mskcc/beagle#996 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Check isCmoRequest flag on import
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#987 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Jobs restarted through the retry endpoint start with resume_attempts 0
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#984 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Job restart failed to submit if job_store is cleaned up
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 20/100

    mskcc/beagle#963 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Notifier search does not search on status
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    mskcc/beagle#939 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Modified_date should have db_index=true
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#929 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Queries on created_date do not work
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 15/100

    mskcc/beagle#928 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add migration to backfill jira ids to jobgroups
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#927 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Need to backfill deliveryDate metadata on empty fields
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

    mskcc/beagle#926 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Many of the jobgroup jira_id fields are empy
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    mskcc/beagle#925 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Handle JIRA status when 0 samples are imported
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#924 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Number of runs that complete differs from the number of runs that succeeded in OperatorRun
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#920 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Some pooled normal fastq files show up twice in the mapping file
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 30/100

    mskcc/beagle#917 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Elastic apm configuration parameters should be set through env
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 38/100

    mskcc/beagle#915 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Assign study id(s) to sample metadata, IMPACT/HemePACT data sets mostly
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#891 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Refactor runner/tasks to work with abstract RunObjects in order to support Nextflow
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

    mskcc/beagle#888 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [MetaDB] Separate NATS job into different queue
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    mskcc/beagle#887 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • [MetaDB] - Change deploy script to start NATS listening job
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#886 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Update helix filters operator output directory
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#885 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Argos operator - need to fix pairing with pooled normals through /v0/run/operator/pairs
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#884 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Missing conflict reasons
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    mskcc/beagle#880 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • filter_redact=True behavior inconsistent; what is expected behavior
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

    mskcc/beagle#877 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Restarting jobs with updates to inputs
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    mskcc/beagle#875 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Standardize logging for Celery tasks
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#863 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Hiseq Rapid Run and Hiseq High Output conflict
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#854 · 4 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • For ETL, assign dirs, subdirs, and files being moved to CMO storage space to group cmoigo
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#846 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Add PipelineType
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#843 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Pipeline Completed before all runs are completed
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#833 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Fix started time for runs
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 10/100

    mskcc/beagle#826 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Job notification when an operator receives bad inputs errors out
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

    mskcc/beagle#821 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Deployment strategy for Voyager
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    mskcc/beagle#820 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Updated metadata JSON from beagle_etl sometimes don't output all json files into directory
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#806 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Use Batch call to get Status of Job from Ridgeback
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    mskcc/beagle#803 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Put work dir, lsf.log, input.json paths in Jira comments
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#801 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Regex query does not seem to be working
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    mskcc/beagle#786 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • parallelize access operators
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    mskcc/beagle#785 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Index table and endpoint for autocomplete
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#777 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Value queries on the same field should be treated as OR queries
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    mskcc/beagle#775 · 3 comentarios · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Configure LSF walltime per Run
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    mskcc/beagle#742 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

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