Annovar v0.2 is problematic and needs a correction.
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Bug
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Inizia leggendo Galaxy issue #4001 e i tre report Biostars collegati per comprendere i problemi di ANNOVAR v0.2. Analizza il comportamento segnalato di VCF e riesamina la questione non confermata relativa a Tabular-input; il lavoro è completato quando i casi di input interessati sono corretti e verificati rispetto a quei report.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Details here: https://github.com/galaxyproject/galaxy/issues/4001
The problem is not new and has been reported since the tool was updated (~18 months ago). Not only is VCF input a problem for some, but possibly also Tabular (note: usage-problems Tab input have not been specifically reviewed).
Biostars posts about how this is impacting users at Galaxy main:
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 37
- Fork
- 94
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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