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86 repository indicizzati · Vedi su GitHub

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Data intensive science for everyone.

Python · 1859 stelle
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A collection of Galaxy-related training material

HTML · 367 stelle
tools-iuc
Tool Shed repositories maintained by the Intergalactic Utilities Commission

HTML · 201 stelle
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Galaxy Community Hub

TeX · 138 stelle
ansible-postgresql
An Ansible role for managing a PostgreSQL server

Python · 126 stelle
ansible-slurm
Ansible role for installing and managing the Slurm Workload Manager

Jinja · 122 stelle
planemo
Command-line utilities to assist in developing Galaxy and Common Workflow Language artifacts - including tools, workflows, and training m...

Python · 110 stelle
bioblend
A Python library for interacting with the Galaxy API

Python · 108 stelle
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Galaxy Admin Training

HCL · 62 stelle
ansible-galaxy
An Ansible role for managing a Galaxy server

Jinja · 58 stelle
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Galaxy Workflows maintained by the Intergalactic Workflow Commission

Vue · 57 stelle
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Minimal setup required to run Galaxy under Kubernetes

Go Template · 47 stelle
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Distributed job execution application built for Galaxy

Python · 46 stelle
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Easily launch cloud applications.

Python · 42 stelle
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Easily create and manage compute clusters on any Cloud.

Python · 38 stelle
galaxy-mcp

Python · 38 stelle
tools-devteam
Contains a set of Galaxy Tools mostly written by the Galaxy Team.

Python · 37 stelle
usegalaxy-playbook
Ansible Playbook for usegalaxy.org

Shell · 35 stelle
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Library for managing Galaxy plugins - tools, index data, and workflows.

Python · 34 stelle
galaxy-language-server
Galaxy Language Server to help in Galaxy (https://galaxyproject.org/) tool wrappers development.

Python · 29 stelle
66 altri repository si trovano su Vedi su GitHub

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Mypy strict ratchet reports line-shifted pre-existing errors as new Aperta

galaxyproject/galaxy#23708 · 1 assegnatario · Aperta il 24/9/2026
[RFC] Utility-first styling with Tailwind v4 and removing Bootstrap Aperta

area/accessibility area/client area/UI-UX kind/refactoring procedure/discussion

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

galaxyproject/galaxy#23702 · 1 commento · 1 reazione · Aperta il 24/9/2026
Update Galaxy Testing Docs Aperta

area/documentation area/testing kind/bug kind/enhancement

galaxyproject/galaxy#23695 · 1 assegnatario · Aperta il 24/9/2026
Add RT/RI prediction workflows from RCI-M project Aperta

galaxyproject/iwc#1382 · 1 assegnatario · Aperta il 24/9/2026
MultipleResultsFound: Multiple rows were found when one or none was required Aperta

galaxyproject/galaxy#23690 · 1 assegnatario · Aperta il 24/9/2026
workflow loader: colliding workflow IDs silently overwrite each other Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1772 · 1 assegnatario · Aperta il 24/9/2026
workflow gate: index workflow categories by TRS ID at load time Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1771 · 1 assegnatario · Aperta il 24/9/2026
Methods-section export — draft methods + provenance supplement Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/loom#512 · Aperta il 23/9/2026
Review mode — harness-enforced, phased, independent re-examination Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

galaxyproject/loom#511 · Aperta il 23/9/2026
Snapshot all inputs before execution — pre-invocation manifest + gate Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/loom#510 · Aperta il 23/9/2026
Verify acquired data against declared metadata + exclusion ledger Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/loom#509 · Aperta il 23/9/2026
Severity-tiered surfacing — blocking findings must be unmissable Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100

galaxyproject/loom#508 · Aperta il 23/9/2026
Typed readiness/issues record in the notebook, gated before invocation Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/loom#507 · Aperta il 23/9/2026
Parity report against Galaxy's built-in MCP server Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/galaxy-mcp#121 · Aperta il 23/9/2026
Plan: optional GitHub identity and reproducible repository–notebook–Galaxy publication Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

galaxyproject/loom#506 · Aperta il 23/9/2026
UI/Routing: Inconsistent and legacy URL routing for viewing Pages (/pages/view?id=... vs /published/page vs /u/<username>/p/<slug>) Aperta

galaxyproject/galaxy#23678 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
Decision: snake_case on the TS MCP wire? Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/galaxy-mcp#120 · Aperta il 23/9/2026
Live scenario suite over MCP stdio, run against both servers Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/galaxy-mcp#119 · Aperta il 23/9/2026
Shared golden vectors that both test suites run Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/galaxy-mcp#118 · Aperta il 23/9/2026
Parity report: generate PARITY.md from the surface manifest and the divergence registry, and ratchet the registry in CI Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100

galaxyproject/galaxy-mcp#117 · Aperta il 23/9/2026
Correction for beast2_beast at UseGalaxy.eu Aperta

bug site/eu

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/usegalaxy-tools#1734 · Aperta il 23/9/2026
Extended Metadata Doesn't Collect Job Metrics? Aperta

kind/bug

galaxyproject/galaxy#23667 · 3 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
Repeating `--mode` gets past the local-exec pin Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 70/100

galaxyproject/loom#503 · Aperta il 23/9/2026
exec-guard lets a few shell spellings read or clobber the brain config and state dirs Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100

galaxyproject/loom#502 · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: status indicator treatment (replace emoji?) Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1767 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: loading, error and empty states Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1766 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: surface post-completion CTAs in the chat on mobile Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1765 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: mobile tabbed layout (History / Chat / Setup) Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1764 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: analysis setup panel with grouped rows, counter and removable selections Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1763 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: suggested next steps as clickable action rows Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1762 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: chat polish — messages, tables and composer Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1761 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
assistant-ui: left sidebar with title, new analysis, chat history and disclaimer Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1760 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
[Epic] Assistant UI redesign (behind the assistant-ui feature flag) Aperta

galaxyproject/brc-analytics#1758 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2026
Auto-follow-up polish: replay skipped follow-ups, fix mixed toast when the cap is hit Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 70/100

galaxyproject/loom#499 · Aperta il 23/9/2026
Dashboards follow-ups from the pre-merge review of #472 Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/loom#497 · Aperta il 23/9/2026
Dashboards: agent-authored custom view (sandboxed HTML widget), removed from #472 for follow-up Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

galaxyproject/loom#496 · Aperta il 22/9/2026
Keep Orbit responsive during long tasks: background Loom workers and Pi upgrade compatibility Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

galaxyproject/loom#492 · Aperta il 22/9/2026
OIDC device flow for API authentication Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

galaxyproject/galaxy#23645 · 1 commento · Aperta il 22/9/2026
Introduce structured dataset operation events for fetch and deferred materialization failures Aperta

galaxyproject/galaxy#23642 · 1 assegnatario · Aperta il 22/9/2026
PICRUSt2 tools failing with blank input parameters when multiple file inputs are required Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

galaxyproject/tools-iuc#8449 · 1 commento · Aperta il 22/9/2026
Proposal: an extension point for the Admin panel Aperta

kind/enhancement

galaxyproject/galaxy#23627 · 1 reazione · 1 assegnatario · Aperta il 22/9/2026
Lint: metadata_source is unvalidated, and format_source accepts any param name Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 76/100

galaxyproject/planemo#1722 · Aperta il 21/9/2026
Enhancement: Adjust Panaroo to interpret collection data correctly (add ".gff" to input file or element identifiers) Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 64/100

galaxyproject/tools-iuc#8448 · Aperta il 21/9/2026
Build and Target a Modern Galaxy Docker Image Aperta

bug enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

galaxyproject/planemo#1721 · Aperta il 21/9/2026
Retire or Modernize the Planemo Virtual Appliance Maybe? Aperta

docs missing enhancement help wanted

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

galaxyproject/planemo#1720 · 1 commento · Aperta il 21/9/2026
Resizing windows in Firefox on macOS does not work with 26.1 Aperta

galaxyproject/galaxy#23613 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 21/9/2026
import histories and workflows from a Terra workspace folder Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 68/100

galaxyproject/gxabm#365 · Aperta il 20/9/2026
Augment freeform-to-Workflow Brief scenarios with real source artifacts Aperta

needs-triage

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

galaxyproject/foundry#592 · Aperta il 20/9/2026
[RFC] Implement How To Document Galaxy Documentation Aperta

area/documentation kind/bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

galaxyproject/galaxy#23604 · 3 commenti · 6 reazioni · Aperta il 19/9/2026

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