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picard_SortSam and sam_sort appear to be performing the same operation

Aperta
  • Qualcosa non va?
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Refactoring
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Ambito
tooling

Direzione di ricerca

Inizia individuando le definizioni degli strumenti picard_SortSam e sam_sort e confrontando le operazioni che espongono. Determina se la duplicazione è intenzionale e registra una decisione chiara sulla loro consolidazione o distinzione; il lavoro è completato quando la confusione degli utenti finali e il comportamento previsto degli strumenti sono stati risolti.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Duplication is desired? This may be confusing for end users. Both samtools and picard are nearly always installed in locals as the first go-to tool packages.

Lingua principale
Python
Stelle
37
Fork
94
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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