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picard_SortSam and sam_sort appear to be performing the same operation

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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Refactorización
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Área
tooling

Línea de trabajo

Comienza localizando las definiciones de las herramientas picard_SortSam y sam_sort y comparando las operaciones que exponen. Determina si la duplicación es intencionada y registra una decisión clara sobre si deben consolidarse o distinguirse; se considera terminado cuando se hayan resuelto la confusión de los usuarios finales y el comportamiento esperado de las herramientas.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Duplication is desired? This may be confusing for end users. Both samtools and picard are nearly always installed in locals as the first go-to tool packages.

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
37
Forks
94
Sin PR fusionados en 30 d

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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