blekhmanlab/compendium

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Metadata ingest service

Stelle: 9
Fork: 0
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 13

Lingua principale: Python
Licenza: Apache-2.0
Ultimo push su GitHub: 27/8/2025
Ultima indicizzazione: 14/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata
Metriche di merge delle PR: Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

13 issue aperte indicizzate

Specify branch for retrieving snakemake repository Aperta

enhancement

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

blekhmanlab/compendium#21 · Aperta il 12/8/2025
Accession list parsing does not accommodate EOF newline char Aperta

bug

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

blekhmanlab/compendium#20 · Aperta il 6/8/2025
Accommodate multiple taxa in database and workflow Aperta

enhancement

blekhmanlab/compendium#18 · 1 assegnatario · Aperta il 12/2/2025
Manager doesn't detect when pipeline errors crashed snakemake Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

blekhmanlab/compendium#14 · Aperta il 17/1/2023
Add ability to restart a failed project as single-end Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

blekhmanlab/compendium#13 · Aperta il 13/1/2023
Add ability to restart a failed project with `matchids` option Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

blekhmanlab/compendium#12 · Aperta il 13/1/2023
Automatic submission of projects miscounts restarted projects Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

blekhmanlab/compendium#11 · Aperta il 12/1/2023
When user requests project status, it should include info from DB Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

blekhmanlab/compendium#10 · Aperta il 12/1/2023
Checking status of re-run jobs overestimates progress Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100

blekhmanlab/compendium#9 · Aperta il 10/1/2023
Restructure project Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

blekhmanlab/compendium#8 · Aperta il 9/1/2023
Pipeline stalls when prefetch can't reach a sample Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 32/100

blekhmanlab/compendium#5 · 4 commenti · Aperta il 8/1/2023
Add testing Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

blekhmanlab/compendium#4 · Aperta il 21/12/2022
Convert to CLI tool Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

blekhmanlab/compendium#1 · 1 commento · Aperta il 20/12/2022

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