Compatibility issues on macbook pro with M1 chip
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Bug
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- python, tensorflow
- Ambito
- machine-learning, operating-systems
Direzione di ricerca
Inizia riproducendo i malfunzionamenti segnalati su un Mac M1: esegui mmvec --help nell’ambiente conda-forge Python 3.7.12, quindi testa l’installazione di QIIME2 2020.6 in un terminale Rosetta. Il lavoro è completato quando sia il comando diretto mmvec sia i comandi QIIME vengono eseguiti invece di produrre gli errori segnalati relativi alle istruzioni hardware o al caching.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Hello,
I'm very interested in using your program on my dataset, but I'm having issues getting started. I've tried both the non-qiime2 and qiime2 methods of using the program, but am having compatibility issues both ways. I'm wondering if anyone has experience these issues and has figured out a way to work around them. I've follow instructions online for workarounds for these general errors, specified below. However, much of it involves updating python or tensorflow to newer versions to be compatible with the packages I'm trying to run. Of course, this does not make sense in this scenario since I'm running the version specified within mmvec.
By making the mmvec_env environment and installing with conda-forge, installation looks successful but then I get the error "zsh: illegal hardware instruction mmvec --help" when I try to test the functionality. Other forums say that this is likely an issue between tensorflow and python compatibility, but I'm running python v. 3.7.12 as specified in the mmvec environment.
In qiime2, I installed qiime2-2020.6 in a Rosetta terminal and everything seemed to work until trying to install the mmvec plugin. Once I reset the cache, it returns the error "QIIME is caching your current deployment for improved performance. This may take a few moments and should only happen once per deployment" anytime I try to run a qiime command instead of running the command.
Any ideas from developers or the community?
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 133
- Fork
- 54
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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