Network layouts handle negative values
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- r
- Ambito
- data-visualization
Direzione di ricerca
Start with the force-directed layout entry points and igraph behavior for networks containing positive and negative edge weights. Compare results on representative networks rather than only small examples, including the WGCNA negative-edge use case. Done means the required behavior and scope are specified, including whether positive-only, negative-only, both, or absolute-value handling is needed.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
I did some looking and folks don't seem to be happy with how the force-directed layouts in igraph handle negative weights. Often the examples i saw only had a few nodes, so i think we should see how it goes with our networks and modify if needed.
If we do need to modify, one fun idea would be to have options for force-directed: positive only, negative only, both, or absolute value. Basically ways to keep all the edge weights on one side of 0 (except the "both" option). Kathryn was talking about how she's actually only interested in negative edges for the wgcna stuff, which led me to think about this plan.
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 1
- Fork
- 0
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Guida per i contributori
Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
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