Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

Mountainsort4 errors when running on example recording, windows 11

Aperta
  • Qualcosa non va?
#4,826 16 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Attiva
Stack tecnologico
python
Ambito
data

Direzione di ricerca

Start by reviewing the attached spikeinterface_log.json and the reported old_api_utils code path for the location property, then run the provided toy_example with Mountainsort4 to reproduce the error. Done means the example runs successfully with Mountainsort4; the issue does not identify a specific file to change or establish the cause.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

bug in sorter

Hi all,

First, thanks for the amazing work with spikeinterface. I'm looking into it again after a few years and the progress since then is really impressive!! This is really much appreciated.

My current problem is with running Mountainsort 4 via spike interface, either on my own data or on the dummy data created in this page.
(code for the dummy recording:
this_rec, _ = se.toy_example( duration=30, seed=0, num_channels=64, num_segments=1
)

I'm getting an error during the running of Mountainsort 4 which probably has a really easy fix, but I'm not sure how to find out what it is:

v = values[ind[0]]
TypeError: 'NoneType' object is not subscriptable

Attaching the spikeinterface_log.json file:
spikeinterface_log.json

I get the same error whether I run it after installing it, or with the "Docker".

Looking more into it the error seems to relate to this code in 'old_api_utils' when 'property' = location,
but I'm not sure how to fix that:
Image

Any suggestions? thanks a lot in advance!

--- minimal code example that recreates the problem ---

import spikeinterface.sorters as ss
import spikeinterface.extractors as se 

sorter_name = 'mountainsort4' # note that if you use mountainsort5 here, it works
use_docker = False
overwrite_sorting = True
test_sort_folder = r"./temp"

this_rec, _ = se.toy_example(
    duration=30,
    seed=0,
    num_channels=64,
    num_segments=1
)

print('Running sorter ' + sorter_name)

test_sorting = ss.run_sorter(sorter_name=sorter_name,
    recording=this_rec, verbose = True,
    folder= test_sort_folder,
    docker_image= use_docker, remove_existing_folder=overwrite_sorting)
Lingua principale
Python
Stelle
858
Fork
281
Merge medio
3g 18h
PR unite (30g)
45

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di SpikeInterface/spikeinterface

Tutte le issue di SpikeInterface/spikeinterface

Issue simili

Altre issue su Python

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.