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Unexpected true atoms...

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python

Direzione di ricerca

No source file, test, command, or reproduction steps are mentioned. Start by reproducing the “Unexpected true extra atoms” exception and tracing where it is raised; done should mean the cause of these extra protein atoms is identified and the reported failure is addressed.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

I periodically get:

This is for pure unmotiffed generation of a binder eg.

"Zn_binding_no_motif": "inference.input_pdb=/projects/metalsitenn/RFdiffusion2/inputs/ZN_only.pdb inference.ligand=ZN contigmap.length=25-200 contigmap.contigs=[\\'25-200\\']",

Its always atoms associated with a phenylalanine. Pretty funky. Any wisdom appreciated.

Lingua principale
Python
Stelle
447
Fork
70
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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