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genus: Calephelis species: laverna

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
data, databases

Direzione di ricerca

Inizia esaminando il flusso di risoluzione GBIF esistente e l’issue #15, quindi individua i punti in cui ranghi interni sparsi possono attivare query verso COL e OTOL. Il lavoro è completato quando una gerarchia sparsa può essere integrata o sostituita con dati aggiuntivi dei provider, preservando il risultato del taxon risolto.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

edge case enhancement

An entry "Calephelis laverna" whose resolution with GNVerifier using GBIF provides sparse yet confident rank hits at just the kingdom, genus, and species levels. The final resolution is, e.g.:

{
  "uuid": "109fff25-cccb-4c5f-823e-89da7d1c8d76",
  "scientific_name": "Calephelis laverna",
  "source_dataset": "unknown",
  "source_id": "20386037",
  "resolution_status": "EXACT_MATCH_PRIMARY_SOURCE_ACCEPTED_SIMPLE",
  "kingdom": "Animalia",
  "phylum": null,
  "class": null,
  "order": null,
  "family": null,
  "genus": "Calephelis",
  "species": "Calephelis laverna",
  "resolution_path": "RESOLVED",
  "resolution_strategy": "ExactMatchPrimarySourceAcceptedSimple",
  "final_query_term": "Calephelis laverna",
  "final_query_rank": "species",
  "final_data_source_id": 11,
  "common_name": "Animal"
}

This is a shortcoming of the GBIF Backbone Taxonomy.

It should be mitigated by detecting a sparse internal resolution (here, 4 missing values at internal ranks) by querying additional data providers (COL, OTOL) to either supplement or supplant this data.

For example, COL contains filled out hierarchy data:

Eukaryota (domain) >> Animalia (kingdom) >> Arthropoda (phylum) >> Insecta (class) >> Lepidoptera (order) >> Papilionoidea (superfamily) >> Riodinidae (family) >> Riodininae (subfamily) >> Riodinini (tribe) >> Calephelis (genus) >> Calephelis laverna (species)

The solution to this may also address #15.

Lingua principale
Python
Stelle
20
Fork
0
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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